# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID Herpes_env #=GF AC PF01673.19 #=GF DE Herpesvirus putative major envelope glycoprotein #=GF AU Bateman A;0000-0002-6982-4660 #=GF GA 25.0 25.0 #=GF NC 24.4 20.2 #=GF TC 26.0 25.0 #=GF SE Pfam-B_1084 (release 4.1) #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Family #=GF RN [1] #=GF RM 1331295 #=GF RT Glycoprotein 300 is encoded by gene 28 of equine herpesvirus #=GF RT type 1: a new family of herpesvirus membrane proteins? #=GF RA Whittaker GR, Bonass WA, Elton DM, Halliburton IW, Killington #=GF RA RA, Meredith DM; #=GF RL J Gen Virol 1992;73:2933-2940. #=GF RN [2] #=GF RM 1322965 #=GF RT A novel herpes simplex virus gene (UL49A) encodes a putative #=GF RT membrane protein with counterparts in other herpesviruses. #=GF RA Barnett BC, Dolan A, Telford EA, Davison AJ, McGeoch DJ; #=GF RL J Gen Virol 1992;73:2167-2171. #=GF DR INTERPRO; IPR002597; #=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region; #=GF CC This family consists of probable major envelope glycoproteins #=GF CC from members of the herpesviridae including herpes simplex #=GF CC virus, human cytomegalovirus and varicella-zoster virus. Members #=GF CC of the herpesviridae have a dsDNA genome and do not have a RNA #=GF CC stage during there replication. #=GF SQ 141 Q6R5V5.1/44-641 LFNELLLSAHAL.K.INSI.........QDVQSDDTVED................................................A.GDIG......NEV-----....................................IHSELVTF.I..ETAADV............YALDR..QCLVCRVL.DMY.RRNFGLSALWMADYAFLCSKCLGSPPCATATFIAAFEFVYIMDKHFLSDHG....CTLVR.SFGKKLLTLEDIQRHFFLHGCFR..TDGGVPGRRhdev...................itsrSKQGRlvgrrg........kfstagdAKVL...YSNYSYLAQSATRALLMTLSDL..GSAPLE.................----.....VI..EG...RQKSisgdvrnelrdgiesrkrvahvihsvgpvhscpttLSVALAGWKDCAKNVECNFFQ----..-.LE..............SCTLRASSEDNDYEH.EWELRASEEKLnvvenvqdmqqi................dasqcehheharnEDCTM...GYGNLVLLLLAGTGSAPEAA.........SELA.fMAAK..................VR.RETVDIFWKNHRREFA.....NDV.TAAYSACYG...EDSEPDLELGPLMITQLKHAITKGGTSAECLLCNLLLIRTY.WL.AM.RKFKRDIITYSANNIGLFHSIEPVLDA..WRSQGHRT............DLGDEGC.................................FVTLMKSAGTEAIYKHLFCDPMCAARIAQTNPRSLFDH..P.DA..TNHDELALYKA..RLASQ...NHF..E.GR...V...CA...GLWALAYTFKTYQVFPPR...PTALSAFVKDAGALLQRHSISLISLEHTLGVYV Q9E6N7.1/44-641 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