# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID Wzy_C #=GF AC PF04932.16 #=GF DE O-Antigen ligase #=GF AU Bateman A;0000-0002-6982-4660 #=GF GA 25.3 25.3 #=GF NC 25.2 25.2 #=GF TC 25.3 25.3 #=GF SE Pfam-B_5033 (release 7.6) #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Family #=GF RN [1] #=GF RM 1624462 #=GF RT Comparison of lipopolysaccharide biosynthesis genes rfaK, rfaL, #=GF RT rfaY, and rfaZ of Escherichia coli K-12 and Salmonella #=GF RT typhimurium. #=GF RA Klena JD, Pradel E, Schnaitman CA; #=GF RL J Bacteriol. 1992;174:4746-4752. #=GF DR INTERPRO; IPR007016; #=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region; #=GF CC This group of bacterial proteins is involved in the synthesis of #=GF CC O-antigen, a lipopolysaccharide found in the outer membrane in #=GF CC gram-negative bacteria. This family includes O-antigen ligases #=GF CC such as E. coli RfaL [1]. #=GF SQ 5302 A0A3R5QS22.1/233-393 IITSILF..AALV.SS...L...T...R..S...S.W....I.SL......VI.Y...I..T....I....L..F...A....L...S...I...KNKK..............................................................................RL.INWFL.....VLV..A...M...I....V...I..F..L.-.-..Glnyl........................................................................................................................................................................................................ksgqL.N..T..R..L..I...S...I.S...N..-...-..-.D.AT...SL.QQ-......................................................................................................................................................SGNE....M..A.GS..........GR.V.YI..W......K....N.GL...N...L....L.....W....D.....K..P.L......................LG.Y.Gvd....................................nfGAAFM.S..K...Y.S.N..E.......A..K....F......M.......V....K......N......L......G.......G.....I......V.......T....K......A......H.....N..EYLE.I.LINNGI.L.SLAIYI A0A3R5QS22.1/664-822 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