# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID Wzy_C #=GF AC PF04932.16 #=GF DE O-Antigen ligase #=GF AU Bateman A;0000-0002-6982-4660 #=GF GA 25.3 25.3 #=GF NC 25.2 25.2 #=GF TC 25.3 25.3 #=GF SE Pfam-B_5033 (release 7.6) #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Family #=GF RN [1] #=GF RM 1624462 #=GF RT Comparison of lipopolysaccharide biosynthesis genes rfaK, rfaL, #=GF RT rfaY, and rfaZ of Escherichia coli K-12 and Salmonella #=GF RT typhimurium. #=GF RA Klena JD, Pradel E, Schnaitman CA; #=GF RL J Bacteriol. 1992;174:4746-4752. #=GF DR INTERPRO; IPR007016; #=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region; #=GF CC This group of bacterial proteins is involved in the synthesis of #=GF CC O-antigen, a lipopolysaccharide found in the outer membrane in #=GF CC gram-negative bacteria. This family includes O-antigen ligases #=GF CC such as E. coli RfaL [1]. #=GF SQ 11013 A0A3R5QS22.1/233-393 IITSILF..AAL..V.S..S...L....T...R..S....S.W....I.SL......VI.Y...I...T....I....L......F...A......L...S...I...K.NKK...............................................................................RL.INWFL.....VLV..A....M...I....V...I..F....L..-.-..Glnyl........................................................................................................................................................................................................ksgqL...N..T..R..L...I...S...I..S....N...-....-...-...D...AT...S..L.QQ-......................................................................................................................................................SGNE....M..A.G.S.............GR.V.Y.I..W......K....N......GL...N...L....L.....W....D.....K....P..L......................LG.Y.Gvd....................................nfGAAFM.S..K...Y...S...N..E.......A...K....F.......M.......V.......K.......N......L......G.......G.......I......V...........T......K.......A......H.....N......EY.L.E.I.LINNG.I.L..SLAIYI 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M1MMR2.1/246-541 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G7M7G6.1/253-542 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