# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID RgpF #=GF AC PF05045.13 #=GF DE Rhamnan synthesis protein F #=GF AU Moxon SJ;0000-0003-4644-1816 #=GF SE Pfam-B_5448 (release 7.7) #=GF GA 25.00 25.00; #=GF TC 26.40 25.00; #=GF NC 24.60 24.00; #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Family #=GF RN [1] #=GF RM 12010977 #=GF RT Expression and characterization of streptococcal rgp genes #=GF RT required for rhamnan synthesis in Escherichia coli. #=GF RA Shibata Y, Yamashita Y, Ozaki K, Nakano Y, Koga T; #=GF RL Infect Immun 2002;70:2891-2898. #=GF DR INTERPRO; IPR007739; #=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region; #=GF CC This family consists of a group of proteins which are related to #=GF CC the Streptococcus rhamnose-glucose polysaccharide assembly #=GF CC protein (RgpF). Rhamnan backbones are found in several O #=GF CC polysaccharides of phytopathogenic bacteria and are regarded as #=GF CC pathogenic factors [1]. #=GF SQ 3722 R7QXS2.1/41-544 ILVV.C.N.G..K.L...T.SE.G...R..K...KLEE....V.TP.NV..LVRE.NK.GF..DVWA.YKT.G...L.....E.H.Y...G.W.D..K.I.K...SF.D.E..VI...MMNFT..I..M......G.P.V...Y....P........L.E.E...M.F.HA.MD....KRD....L.....D.F......W.G..I.TK........................FH.EF..kDGDPFGt.........iPYG.Y.IP....A....H....I....Q..S..H.F.IA....V....RK.......PM.......LN.SLE..Y.....QS..Y.WD..N.M.V.MI..H.D.....Y.....R....E.........AV.GC.HE.AIF...TK...K......F.....S.D.....A......GFKWD......VY...A.DLE.E.G..--................................YN.NHP.V.L..C...A.T.R.....RM....IEE...KRCPIF.KRRSFM.Q....N.Y...D.....N..I..L....H.....D....T...AG.E.NAIEA...Y.E..Y.IDR.H.T.D..YDV..DM.IWQNIL..RLENQA.D.I..K.KN.M.Q...L.N.......FVLPED.....M......S......K.P.ADDILK...............-NRKVA.LVLH...FYF......E.D.L....A.EY.C.L.H.Y.V.....Q..S.M..P...P.....E...A...D.IY...V....T....T......G.....S...E...K...K..K....E...L......I.E.K..T...F.....S.V.LP........NKV...KVI.L.I....EN...R...GR...D.V...SA..L..L..V.G.T...K...D..F..I.M.D........YD..Y..V.C..F..V..HDK.K............V..T....Q.....L...K....P..........D.....T..V............G......A......S.....F....S.YK.....CFENLL...T..S....R....D....F.V.N...N.V..L..H.T.F.EAN.P.RVGLLT.P.PP...P..N.HG......D.yY.I..T..V.....GL.....EWG.K.N...........YKI.TKKL.....A.E.K.L...G.I.............TV.P.I.AE..E..K.E.P..I.A.P..LGTMFWFRP...K...AM..K....LLF.D........Q....D........W.E.Y..T...D.F..PP........E...P.NK......TDG.T.LLHAV.ERI.YSYVVQQEGY 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E3GGI4.1/41-545 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A0A3R6RUJ4.1/41-544 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C0BUR3.1/43-544 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G9PNP5.1/41-542 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U1PI18.1/41-542 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O66255.1/34-530 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A0A1Q6PK13.1/41-511 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A0A1V0NZ89.1/34-526 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A0A4V3BUT4.1/48-542 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