# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID PAAR_motif #=GF AC PF05488.14 #=GF DE PAAR motif #=GF AU Yeats C;0000-0003-0080-6242 #=GF GA 27.0 27.0 #=GF NC 26.9 26.9 #=GF TC 27.0 27.0 #=GF SE Yeats C #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Motif #=GF DR INTERPRO; IPR008727; #=GF DR SO; 0001067; polypeptide_motif; #=GF CC This motif is found usually in pairs in a family of bacterial #=GF CC membrane proteins. It is also found as a triplet of tandem #=GF CC repeats comprising the entire length in a another family of #=GF CC hypothetical proteins. #=GF SQ 3637 A0A109JYB0.1/19-59 ----.----.-....-..--....--..........................-.......--.---.-.....-..--..---..............--.....-...-...L.....A...CA.....................................................QSSs......qpGVV..TS....GA..S.G....V...TVN...G.KPAA.R.S.G.D...T...T.S...NGGPLV- A0A109JYB0.1/25-84 ----.SSQP.G....V..VT....SG..........................A.......SG.VTV.N.....G..KP..AAR..............SG.....D...T...T.....S...--.....................................................NG-.........GPL..VE....GV..P.N....V...LIN...G.KPAV.V.I.G.G...R...T.H...CGGK--- A0A109JYB0.1/49-107 -GDT.TSNG.G....P..LV....EG..........................V.......PN.VLI.N.....G..KP..AVV..............IG.....G...R...T.....H...CG.....................................................-GK.........--A..TS....GS..H.G....V...FIN...G.KPMV.R.E.G.D...L...T.S...------- A0A250KNL3.1/19-88 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---V.PHVG.G....P..IL...pAG..........................V.......PT.VLI.G.....G..VP..AAC..............VG.....D...M...A.....T...CSg...................................................pPDS.........--I..VM....GS..S.T....V...LIG...G.KPAA.R.M.G.D...S...T.A...HGGTIV- L8JVC8.1/10-75 ----.PHVG.G....P..VI...gPG..........................A.......PT.VLI.G.....G..MP..AAV..............MG.....D...S...C.....V...CVg...................................................pPD-.........-TI..VK....GS..S.T....V...MIG...G.KPAA.R.Q.G.D...T...T.A...HGGQIV- A0A2S5KL24.1/19-86 -GRT.PHVG.G....P..VS....SG..........................S.......GN.VFI.G.....G..LP..AAR..............VG.....D...N...L.....V...CNg...................................................pPD-.........-TI..NQ....GS..A.T....V...FIN...G.KPAA.R.M.G.D...S...T.A...HGGVIV- A0A239C8U9.1/17-86 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-GDP.TAHG.G....T..IA....VG..........................D.......PT.VLI.N.....G..LP..AAR..............QG.....D...M...H.....V...YP.....................................................MCN.........---..--....--..-.-....-...---...-.----.-.-.-.-...-...-.-...------- A0A2P6BZW6.1/46-101 -GPS.PHVG.G....P..IS....MG..........................A.......PT.VMI.N.....G..MP..AAR..............MG.....D...V...C.....T...CSg...................................................pPD-.........-TI..VG....GE..P.T....V...MINs.gG.NPV-.-.-.-.-...-...-.-...------- A0A221SYL6.1/18-85 -GWT.PHVG.G....P..IV....AG..........................S.......GN.VRI.G.....G..SM..AAR..............VG.....D...M...C.....T...CQg...................................................pPDS.........--I..AR....GS..G.T....V...RIN...G.LPAA.R.L.G.D...T...T.V...HGGVIV- I4VID4.1/9-77 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