# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID APC_basic #=GF AC PF05956.12 #=GF DE APC basic domain #=GF AU Yeats C;0000-0003-0080-6242 #=GF GA 25.0 25.0 #=GF NC 21.6 24.1 #=GF TC 30.9 29.8 #=GF SE Yeats C #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Family #=GF RN [1] #=GF RM 9654054 #=GF RT A domain within the tumor suppressor protein APC shows very #=GF RT similar biochemical properties as the microtubule-associated #=GF RT protein tau. #=GF RA Deka J, Kuhlmann J, Muller O; #=GF RL Eur J Biochem 1998;253:591-597. #=GF DR INTERPRO; IPR009234; #=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region; #=GF CC This region of the APC family of proteins is known as the basic #=GF CC domain. It contains a high proportion of positively charged #=GF CC amino acids and interacts with microtubules [1]. #=GF SQ 422 W5LXB8.1/1900-2255 VVFRGRTVIYMPNpKKETNSSQKPPLKKTSPKT...............ET.PV.....K.N.PNL.AQQRSRSLHRLGRANDS.TELSLP..KRSS.T..PP.ARIPKS.TSS..GSSQN..STPSRQPQKKLT.SPSQSS.KQI.P.KKDV.K-.----..........-PTNSP...T.DKKTSPAA.SP.S.PKSPA.hKKTQKSPVRIPFMQTPSR.QPMASRTISPLVTNQPSp...giSRQNTQLKRT-......-LPANRLDLVRMSSTRSSSSE.SDRA...GFLRQLTFIKESPS.-LLRQRSEIPSS...RS.................V.PT-S.KCASPRK.MR.......PGAPAAFLC.......S.SRCQELKGVGQGPRETQDegqgqg............aqrqraALSRA.SSS..DR..G..LSGVRPARRTSSESPCRAPQ..KNISga......wqRERDTFKRHSSSPHINILKRATSRSSILS W5LX76.1/1760-2115 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