# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID Protamine_like #=GF AC PF06382.13 #=GF DE Protamine and protamine like #=GF PI DUF1074; #=GF AU Moxon SJ;0000-0003-4644-1816 #=GF AU El-Gebali S;0000-0003-1378-5495 #=GF SE Pfam-B_14962 (release 9.0) #=GF GA 21.30 21.30; #=GF TC 21.30 21.30; #=GF NC 21.20 21.20; #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Family #=GF CL CL0114 #=GF RN [1] #=GF RM 15988027 #=GF RT Replacement by Drosophila melanogaster protamines and Mst77F of #=GF RT histones during chromatin condensation in late spermatids and #=GF RT role of sesame in the removal of these proteins from the male #=GF RT pronucleus. #=GF RA Jayaramaiah Raja S, Renkawitz-Pohl R; #=GF RL Mol Cell Biol. 2005;25:6165-6177. #=GF RN [2] #=GF RM 26673329 #=GF RT Prtl99C Acts Together with Protamines and Safeguards Male #=GF RT Fertility in Drosophila. #=GF RA Eren-Ghiani Z, Rathke C, Theofel I, Renkawitz-Pohl R; #=GF RL Cell Rep. 2015;13:2327-2335. #=GF DR INTERPRO; IPR024460; #=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region; #=GF CC This family consists of several insect proteins including #=GF CC protamine A (ProtA), protamine B (ProtB) and protamine-like #=GF CC protein 99C (Prtl99C) from Drosophila melanogaster. They contain #=GF CC a HMG-box and are involved in chromatin compaction during #=GF CC spermiogenesis [1, 2]. Prtl99C is a sperm chromatin-associated #=GF CC protein that is essential for male fertility [2]. #=GF SQ 319 Q9V3S3.1/1-146 MSSNNVNECKSLWNGIISISAKDESPKGLTEMCNHP...I...RR.A...PQ.K....C.K.PM.K....SC...A.........KP..R.......R.....K..A.....A........C.........A.....K.A....T.......R.............P....K.VK...C...A......P..R.Q........K.....CS..K..QG.......P...V...T....N......N.......AYL.NF....V....R....S....F....RK....K....H..C.....N..L..K.......P....R....E..L..I......AK.A.A.K.AW....ARLSENRK....DRYRR....................M..AC....KV..TT...............................SERH.....KR.RRICQQY Q8T3U9.1/1-145 MSTNNVNECKSLWNGIISISAKDESPKGLTEMCNHP...I...RR.V...PQ.K....C.K.PI.K....SC...A.........KP..R.......R.....K..A.....A........C.........A.....K.A....T.......R.............P....K.VK...C...A......P..R.Q........K.....CS..K..QG.......P...V...T....N......N.......AYL.NF....V....R....S....F....RK....K....H..C.....N..L..K.......P....R....E..L..I......AK.A.A.K.AW....ARLSENRK....DRYRR....................M..AC....KV..TT...............................SERH.....KR.RRICQQ- Q9VJR1.1/1-144 MSSNNVNECKSLWNGIISISAKDESPKGLTEMCNHP...K...RR.A...PP.K....C.K.PM.K....SC...A.........KP..R.......R.....K..A.....A........C.........A.....K.A....T.......R.............P....K.VK...C...A......P..S.Q........K.....CS..K..QG.......P...V...T....N......N.......AYL.NF....V....R....F....F....RK....K....H..C.....D..L..K.......P....Q....E..L..I......AE.A.A.K.AW....AELPEHRK....DRYRR....................M..AC....KV..TT...............................SERH.....KR.RRICK-- Q24405.1/1-109 MSTNNVNECKSLWNGIISISAKDESPKGLTEMCNHP...I...RR.A...PQ.K....C.K.PM.K....SC...A.........KP..R.......R.....K..A.....A........C.........A.....K.A....T.......R.............P....K.VK...C...A......P..R.Q........K.....CS..K..QG.......P...V...T....N......N.......AYL.NF....V....R....S....F....RK....K....H..C.....N..L..K.......P....R....E..L..I......AK.A.-.-.--....--------....-----....................-..--....--..--...............................----.....--.------- A0A6P8KJA7.1/1-145 MSSNNANDCKSLCKGIITISAKDESPKGFTEMCKQP...R...RS.V...PS.K....C.K.PV.K....TC...A.........KP..R.......R.....K..A.....A........C.........G.....K.A....S.......R.............P....K.VKs.rC...A......T..K.P........K.....CS..K..QG.......P...I...T....S......N.......GYL.NF....I....R....S....F....RK....K....H..C.....D..M..K.......P....R....Q..L..I......AE.A.A.K.AW....AALPEHIK....DRYRR....................M..AC....KV..TT...............................SERH.....RR.RRVC--- B4HXK5.1/1-145 MSSNNANDCKSLCNGITTISAKDESPKGFTEMCKQP...R...RS.V...PS.K....C.K.PV.K....TC...A.........KP..Q.......R.....K..A.....A........C.........G.....K.A....S.......R.............P....K.VKs.rC...A......T..K.A........K.....CS..K..QG.......P...I...T....S......N.......GYL.NF....I....R....S....F....RK....K....H..C.....D..M..K.......P....R....Q..L..I......AE.A.A.K.AW....AALPEHIK....DRYRR....................M..AC....KV..TT...............................SERH.....RR.RRVC--- B4Q5X7.1/1-145 MSSNNANDCKSLCNGIITISAKNESPKGFTEMCKQP...R...RS.V...PS.K....C.K.AV.K....TC...A.........KP..R.......R.....K..A.....A........C.........G.....K.A....S.......R.............P....K.VKs.rC...A......T..R.P........K.....CS..K..QG.......P...I...T....S......N.......GYL.NF....I....R....S....F....RK....K....H..C.....D..M..K.......P....R....Q..L..I......AE.A.A.K.AW....AALPEHVK....DRYRR....................M..AC....KV..TT...............................SERH.....KR.RRVC--- Q24406.1/1-109 MSSNNVNECKSLWNGIISISAKDESPKGLTEMCNHP...K...RR.A...PP.K....C.K.PM.K....SC...A.........KP..R.......R.....K..A.....A........C.........A.....K.A....T.......R.............P....K.VK...C...A......P..S.Q........K.....CS..K..QG.......P...V...T....N......N.......AYL.NF....V....R....F....F....RK....K....H..C.....D..L..K.......P....Q....E..L..I......AE.A.-.-.--....--------....-----....................-..--....--..--...............................----.....--.------- Q24402.1/1-109 MSSNNVNECKSLWNGIISISAKDESPKGLTEMCNHP...K...RR.A...PP.K....C.K.PM.K....SC...A.........KP..R.......R.....K..R.....A........C.........A.....K.A....T.......R.............P....K.VK...C...A......P..S.Q........K.....CS..K..QG.......P...V...T....N......N.......AYL.NF....V....R....F....F....RK....K....H..C.....D..L..K.......P....Q....E..L..I......AE.A.-.-.--....--------....-----....................-..--....--..--...............................----.....--.------- B3N5L9.2/69-213 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-------------MGVISMSIEDEKPKALSEMCNHP...M...GR.S...MR.KsmksCaK.PK.K....SC...T.........KP..R.......R.....K..A.....A........C.........A.....K.P....R.......-.............-....-.--...-...-......-..-.-........-.....--..-..--.......-...-...-....-......-.......---.--....-....-....-....-....--....-....-..-.....-..-..-.......-....-....-..-..-......--.-.-.-.--....--------....-----....................-..--....--..--...............................----.....--.------- B4P0W4.1/120-215 ------------------------------------...-...--.-...--.-....-.K.PR.A....AC...A.........KP..R.......R.....S..A.....C........P.........-.....-.-....T.......K.............E....K.DK...C...S......-..R.S........K.....CS..R..PG.......P...V...T....N......N.......GYL.NF....V....R....A....F....RK....K....H..C.....D..L..K.......P....Q....E..L..I......AQ.A.A.K.AW....SKLPEEKK....DRYRR....................M..AC....KV..TT...............................SERH.....KR.RRICN-- A0A6P4H914.1/17-60 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