# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID HtrL_YibB #=GF AC PF09612.11 #=GF DE Bacterial protein of unknown function (HtrL_YibB) #=GF AU TIGRFAMs; #=GF AU Coggill P;0000-0001-5731-1588 #=GF SE TIGRFAMs #=GF GA 24.10 24.10; #=GF TC 24.10 24.10; #=GF NC 24.00 24.00; #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Family #=GF RN [1] #=GF RM 8157607 #=GF RT Molecular analysis of the rfaD gene, for heptose synthesis, and #=GF RT the rfaF gene, for heptose transfer, in lipopolysaccharide #=GF RT synthesis in Salmonella typhimurium. #=GF RA Sirisena DM, MacLachlan PR, Liu SL, Hessel A, Sanderson KE; #=GF RL J Bacteriol. 1994;176:2379-2385. #=GF DR INTERPRO; IPR011735; #=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region; #=GF CC The protein from this rare, uncharacterized protein family is #=GF CC designated HtrL or YibB in E. coli, where its gene is found in a #=GF CC region of LPS core biosynthesis genes [1]. Homologues are found #=GF CC in Shigella flexneri, Campylobacter jejuni, and Caenorhabditis #=GF CC elegans only. The htrL gene may represent an insertion to the #=GF CC LPS core biosynthesis region, rather than an LPS biosynthetic #=GF CC protein. #=GF SQ 210 #=GS A0A2C9KZU3_BIOGL/228-367 AC A0A2C9KZU3.1 #=GS A0A0L0FUC4_9EUKA/517-793 AC A0A0L0FUC4.1 #=GS A0A3S4E6W1_SALBN/18-282 AC A0A3S4E6W1.1 #=GS A0A222YW33_9CAUD/2-267 AC A0A222YW33.1 #=GS A0A1S3I891_LINUN/75-335 AC A0A1S3I891.2 #=GS A0A368H627_ANCCA/42-308 AC A0A368H627.1 #=GS A0A2C9KZI8_BIOGL/153-413 AC A0A2C9KZI8.1 #=GS A0A0R3QQD4_9BILA/379-643 AC A0A0R3QQD4.1 #=GS Q8XDD7_ECO57/8-273 AC Q8XDD7.1 #=GS A0A226E8U7_FOLCA/86-340 AC A0A226E8U7.1 #=GS U2RHE8_9FUSO/9-272 AC U2RHE8.1 #=GS A0A226DE84_FOLCA/45-189 AC A0A226DE84.1 #=GS A0A0N5CS60_THECL/181-431 AC A0A0N5CS60.1 #=GS A0A0L8G3V9_OCTBM/5-255 AC A0A0L8G3V9.1 #=GS A0A0L8GB36_OCTBM/98-355 AC A0A0L8GB36.1 #=GS A0A1I8ERD0_WUCBA/319-386 AC A0A1I8ERD0.1 #=GS A0A210R2E9_MIZYE/92-353 AC A0A210R2E9.1 #=GS A0A0D8XE58_DICVI/136-325 AC A0A0D8XE58.1 #=GS T1ERQ3_HELRO/89-350 AC T1ERQ3.1 #=GS A0A3P7IGC1_ANGCS/61-308 AC A0A3P7IGC1.1 #=GS A0A347VRV4_9HELI/4-134 AC A0A347VRV4.1 #=GS A0A3P6TDM6_LITSI/332-569 AC A0A3P6TDM6.1 #=GS V3ZXJ0_LOTGI/12-267 AC V3ZXJ0.1 #=GS A0A1Y2WNR0_9PEZI/106-269 AC A0A1Y2WNR0.1 #=GS A0A2C9M7W3_BIOGL/1-179 AC A0A2C9M7W3.1 #=GS A0A2T7NN38_POMCA/113-352 AC A0A2T7NN38.1 #=GS K7H7C5_CAEJA/445-711 AC K7H7C5.1 #=GS A0A0N4TC12_BRUPA/280-353 AC A0A0N4TC12.1 #=GS A0A2T7PT00_POMCA/28-266 AC A0A2T7PT00.1 #=GS A0A1Y2WEY3_9PEZI/96-272 AC A0A1Y2WEY3.1 #=GS A0A210PIU0_MIZYE/3-255 AC A0A210PIU0.1 #=GS A8Y4F1_CAEBR/518-784 AC A8Y4F1.2 #=GS A0A260ZBZ3_9PELO/310-348 AC A0A260ZBZ3.1 #=GS A0A0D8XAC6_DICVI/5-65 AC A0A0D8XAC6.1 #=GS A0A0L0G099_9EUKA/135-409 AC A0A0L0G099.1 #=GS A0A016ULQ7_9BILA/42-281 AC A0A016ULQ7.1 #=GS A0A3D8ILC8_9HELI/84-231 AC A0A3D8ILC8.1 #=GS A0A2T7PSZ7_POMCA/24-186 AC A0A2T7PSZ7.1 #=GS A0A2V3IZG4_9FLOR/604-797 AC A0A2V3IZG4.1 #=GS A0A250X7D1_9CHLO/30-298 AC A0A250X7D1.1 #=GS A0A433SM76_ELYCH/73-325 AC A0A433SM76.1 #=GS H3FRU1_PRIPA/382-612 AC H3FRU1.2 #=GS A0A090L6P5_STRRB/402-662 AC A0A090L6P5.1 #=GS HTRL_ECOLI/3-268 AC P25666.2 #=GS A0A1I8ERD0_WUCBA/376-550 AC A0A1I8ERD0.1 #=GS A0A2C9KSG7_BIOGL/1-122 AC A0A2C9KSG7.1 #=GS A0A1T0CHU4_9GAMM/2-139 AC A0A1T0CHU4.1 #=GS A0A292GL11_9CAUD/3-264 AC A0A292GL11.1 #=GS A0A3S1HQH6_ELYCH/1-231 AC A0A3S1HQH6.1 #=GS A0A2T7NHB1_POMCA/3-227 AC A0A2T7NHB1.1 #=GS T1FGK3_HELRO/50-305 AC T1FGK3.1 #=GS A0A1Y2DAE7_9PEZI/119-282 AC A0A1Y2DAE7.1 #=GS K1Q0R5_CRAGI/54-316 AC K1Q0R5.1 #=GS A0A2G5THC4_9PELO/474-740 AC A0A2G5THC4.1 #=GS A0A2C9LYX3_BIOGL/26-167 AC A0A2C9LYX3.1 #=GS A0A1T0CDZ7_9GAMM/2-267 AC A0A1T0CDZ7.1 #=GS A0A2C9KKI2_BIOGL/84-324 AC A0A2C9KKI2.1 #=GS A0A0N5BNU1_STREA/395-655 AC A0A0N5BNU1.1 #=GS A0A2A2LZI4_9BILA/172-309 AC A0A2A2LZI4.1 #=GS A0A0B2VPJ3_TOXCA/337-515 AC A0A0B2VPJ3.1 #=GS A4BYL8_9FLAO/2-257 AC A4BYL8.1 #=GS A0A140NMW5_PROSM/3-268 AC A0A140NMW5.1 #=GS A0A158P657_ANGCA/59-325 AC A0A158P657.1 #=GS A0A0N5CZN5_THECL/342-598 AC A0A0N5CZN5.1 #=GS V3ZML5_LOTGI/76-317 AC V3ZML5.1 #=GS A0A0R3RRG1_9BILA/129-393 AC A0A0R3RRG1.1 #=GS A0A0N4W4Z8_HAEPC/1-258 AC A0A0N4W4Z8.1 #=GS A0A2W2BRQ1_9RHIZ/34-293 AC A0A2W2BRQ1.1 #=GS A0A2T7NHG8_POMCA/3-263 AC A0A2T7NHG8.1 #=GS A0A3S1HBZ5_ELYCH/87-345 AC A0A3S1HBZ5.1 #=GS A0A0L8G3Q5_OCTBM/17-270 AC A0A0L8G3Q5.1 #=GS A0A4U8U5G9_9HELI/15-282 AC A0A4U8U5G9.1 #=GS A0A0N4U1B8_DRAME/134-395 AC A0A0N4U1B8.1 #=GS W2TN06_NECAM/196-462 AC W2TN06.1 #=GS K1PZK1_CRAGI/1-252 AC K1PZK1.1 #=GS A0A239T9H7_9FIRM/2-261 AC A0A239T9H7.1 #=GS A0A3P1W2J1_9FUSO/5-268 AC A0A3P1W2J1.1 #=GS A0A347VRV5_9HELI/1-129 AC A0A347VRV5.1 #=GS A0A2A2LKL3_9BILA/172-433 AC A0A2A2LKL3.1 #=GS A0A2A2LYU8_9BILA/172-350 AC A0A2A2LYU8.1 #=GS B8C4G7_THAPS/288-471 AC B8C4G7.1 #=GS A0A347VN94_9HELI/33-315 AC A0A347VN94.1 #=GS A0A016UMP7_9BILA/42-308 AC A0A016UMP7.1 #=GS K1QPD0_CRAGI/100-338 AC K1QPD0.1 #=GS A0A3M7RZZ0_BRAPC/7-242 AC A0A3M7RZZ0.1 #=GS A0A2C9KZU3_BIOGL/153-234 AC A0A2C9KZU3.1 #=GS L8HAZ5_ACACA/128-334 AC L8HAZ5.1 #=GS A0A0N4TT92_BRUPA/408-669 AC A0A0N4TT92.1 #=GS A0A0K0IUB2_BRUMA/406-661 AC A0A0K0IUB2.2 #=GS A0A0K0FL09_STRVS/395-655 AC A0A0K0FL09.1 #=GS A0A2C9KZX9_BIOGL/129-389 AC A0A2C9KZX9.1 #=GS A0A0L0FUA3_9EUKA/616-887 AC A0A0L0FUA3.1 #=GS A0A2K6W982_ONCVO/419-680 AC A0A2K6W982.1 #=GS A0A0L8FLA6_OCTBM/68-320 AC A0A0L8FLA6.1 #=GS A0A0N4TAK4_BRUPA/1-184 AC A0A0N4TAK4.1 #=GS A0A1I7VXL3_LOALO/66-269 AC A0A1I7VXL3.1 #=GS K1QIJ9_CRAGI/104-324 AC K1QIJ9.1 #=GS R7QVC6_CHOCR/629-810 AC R7QVC6.1 #=GS A0A2T7Q1E1_POMCA/64-325 AC A0A2T7Q1E1.1 #=GS A0A085FZ92_9ENTR/3-268 AC A0A085FZ92.1 #=GS A0A0L0G402_9EUKA/148-413 AC A0A0L0G402.1 #=GS A0A1Y1I871_KLENI/689-961 AC A0A1Y1I871.1 #=GS A0A229GR96_9GAMM/2-266 AC A0A229GR96.1 #=GS R7TMN7_CAPTE/117-375 AC R7TMN7.1 #=GS G0P9P4_CAEBE/462-728 AC G0P9P4.1 #=GS A0A0P7CAG7_9BACT/229-485 AC A0A0P7CAG7.1 #=GS K1RQ12_CRAGI/13-165 AC K1RQ12.1 #=GS A0A0L8G2Z1_OCTBM/75-328 AC A0A0L8G2Z1.1 #=GS A0A183HPC2_9BILA/74-210 AC A0A183HPC2.1 #=GS A0A0G4G8L6_VITBC/39-174 AC A0A0G4G8L6.1 #=GS A0A182EIA7_ONCOC/70-108 AC A0A182EIA7.1 #=GS A0A210PS20_MIZYE/84-318 AC A0A210PS20.1 #=GS A0A2C9L8P4_BIOGL/15-259 AC A0A2C9L8P4.1 #=GS A0A261FZ14_9BIFI/5-92 AC A0A261FZ14.1 #=GS K1RE10_CRAGI/62-304 AC K1RE10.1 #=GS T1CT95_9HELI/1-96 AC T1CT95.1 #=GS A0A1S3H830_LINUN/25-285 AC A0A1S3H830.1 #=GS A0A016UK74_9BILA/119-358 AC A0A016UK74.1 #=GS C5RZM3_9PAST/3-60 AC C5RZM3.1 #=GS A0A3R6YDV3_9FIRM/3-257 AC A0A3R6YDV3.1 #=GS D0GIA4_9FUSO/3-268 AC D0GIA4.1 #=GS H5V406_ATLHE/3-268 AC H5V406.1 #=GS A0A226DQA8_FOLCA/62-326 AC A0A226DQA8.1 #=GS A0A0B2VPJ3_TOXCA/512-542 AC A0A0B2VPJ3.1 #=GS A0A430FR68_9BIFI/9-259 AC A0A430FR68.1 #=GS A0A1S3I5Q1_LINUN/75-316 AC A0A1S3I5Q1.1 #=GS K1PSY7_CRAGI/44-282 AC K1PSY7.1 #=GS A0A0K0EI65_STRER/398-658 AC A0A0K0EI65.1 #=GS A0A210Q6P4_MIZYE/89-331 AC A0A210Q6P4.1 #=GS A0A222MY84_9PROT/1-258 AC A0A222MY84.1 #=GS A0A250X7C0_9CHLO/104-372 AC A0A250X7C0.1 #=GS R5HZ08_9FIRM/2-257 AC R5HZ08.1 #=GS A0A183H348_9BILA/352-614 AC A0A183H348.1 #=GS A7SMD6_NEMVE/104-358 AC A7SMD6.1 #=GS L1IVG1_GUITC/348-593 AC L1IVG1.1 #=GS A0A0N4UNH5_DRAME/57-321 AC A0A0N4UNH5.1 #=GS A0A4U8S9K2_9HELI/5-263 AC A0A4U8S9K2.1 #=GS A0A044UNA8_ONCVO/387-651 AC A0A044UNA8.2 #=GS A0A0N4UXX2_ENTVE/67-328 AC A0A0N4UXX2.1 #=GS R7TDT9_CAPTE/78-315 AC R7TDT9.1 #=GS A0A176TA24_9FLAO/15-244 AC A0A176TA24.1 #=GS G5EDH2_CAEEL/463-729 AC G5EDH2.1 #=GS A0A1I7UAW5_9PELO/470-736 AC A0A1I7UAW5.1 #=GS A0A143YSJ3_9LACT/2-257 AC A0A143YSJ3.1 #=GS A0A2C9LT36_BIOGL/42-199 AC A0A2C9LT36.1 #=GS A0A0S2KEJ9_9GAMM/2-172 AC A0A0S2KEJ9.1 #=GS A0A0N4Y919_NIPBR/117-313 AC A0A0N4Y919.1 #=GS A0A3P6SQF7_LITSI/79-343 AC A0A3P6SQF7.1 #=GS L8GU03_ACACA/94-335 AC L8GU03.1 #=GS A0A182EIA7_ONCOC/103-305 AC A0A182EIA7.1 #=GS A0A1H6TV47_9FIRM/2-257 AC A0A1H6TV47.1 #=GS A0A0K0E0U0_STRER/40-303 AC A0A0K0E0U0.1 #=GS A0A2T7Q1E1_POMCA/562-805 AC A0A2T7Q1E1.1 #=GS A0A261FZ14_9BIFI/99-257 AC A0A261FZ14.1 #=GS K1PJM0_CRAGI/1-127 AC K1PJM0.1 #=GS A0A2S4N221_SHIFL/3-268 AC A0A2S4N221.1 #=GS L8GG62_ACACA/2-148 AC L8GG62.1 #=GS A0A498SKN4_ACAVI/68-332 AC A0A498SKN4.1 #=GS A0A2T7NN22_POMCA/34-153 AC A0A2T7NN22.1 #=GS A0A210QK53_MIZYE/102-361 AC A0A210QK53.1 #=GS E3NLB3_CAERE/1-130 AC E3NLB3.1 #=GS R7UMG4_CAPTE/98-354 AC R7UMG4.1 #=GS A0A3S1ARD0_ELYCH/42-280 AC A0A3S1ARD0.1 #=GS A0A0K0FLD1_STRVS/67-330 AC A0A0K0FLD1.1 #=GS B7GB20_PHATC/126-363 AC B7GB20.1 #=GS V4B1S3_LOTGI/92-348 AC V4B1S3.1 #=GS A0A0U1Q3A3_9BURK/3-260 AC A0A0U1Q3A3.1 #=GS A0A182E2N1_ONCOC/443-624 AC A0A182E2N1.1 #=GS F7XVI7_MIDMI/135-378 AC F7XVI7.1 #=GS A0A2C9LYC4_BIOGL/1-141 AC A0A2C9LYC4.1 #=GS A0A0G4EKV5_VITBC/1-217 AC A0A0G4EKV5.1 #=GS A0A2T7NQ14_POMCA/73-330 AC A0A2T7NQ14.1 #=GS A0A2C9LV45_BIOGL/62-322 AC A0A2C9LV45.1 #=GS A0A1H6TVB1_9FIRM/2-259 AC A0A1H6TVB1.1 #=GS A0A0L8G3Z3_OCTBM/5-262 AC A0A0L8G3Z3.1 #=GS A0A0N4Z0D9_PARTI/67-330 AC A0A0N4Z0D9.1 #=GS A0A0N4TGS7_BRUPA/2-93 AC A0A0N4TGS7.1 #=GS A0A0R3S5R6_9BILA/370-636 AC A0A0R3S5R6.1 #=GS A0A0N5CD50_STREA/67-330 AC A0A0N5CD50.1 #=GS A0A2C9KR31_BIOGL/88-347 AC A0A2C9KR31.1 #=GS A0A1I7VR16_LOALO/343-604 AC A0A1I7VR16.1 #=GS A0A2C9M8T3_BIOGL/68-145 AC A0A2C9M8T3.1 #=GS K7H7C6_CAEJA/457-723 AC K7H7C6.1 #=GS A0A0N5AMF1_9BILA/357-533 AC A0A0N5AMF1.1 #=GS A0A210R711_MIZYE/81-340 AC A0A210R711.1 #=GS A0A1I7VXL3_LOALO/261-358 AC A0A1I7VXL3.1 #=GS A0A1H9C0M7_9FIRM/15-221 AC A0A1H9C0M7.1 #=GS A0A0L0DDS2_THETB/56-317 AC A0A0L0DDS2.1 #=GS K1PK54_CRAGI/1-199 AC K1PK54.1 #=GS K1R3V3_CRAGI/245-481 AC K1R3V3.1 #=GS A0A1D1VFJ0_RAMVA/59-304 AC A0A1D1VFJ0.1 #=GS A0A090MWG3_STRRB/67-330 AC A0A090MWG3.1 #=GS A0A0L0FLC0_9EUKA/591-861 AC A0A0L0FLC0.1 #=GS L8GYT0_ACACA/72-275 AC L8GYT0.1 #=GS K1RR85_CRAGI/62-303 AC K1RR85.1 #=GS A0A2T7NHG7_POMCA/3-263 AC A0A2T7NHG7.1 #=GS A0A0N5AMF1_9BILA/288-365 AC A0A0N5AMF1.1 #=GS A0A3N7CFB7_9BURK/1-257 AC A0A3N7CFB7.1 #=GS A0A0N4ZT84_PARTI/402-662 AC A0A0N4ZT84.1 #=GS A0A0L8G2V5_OCTBM/23-276 AC A0A0L8G2V5.1 #=GS A0A1D1VBM3_RAMVA/58-319 AC A0A1D1VBM3.1 #=GS A0A3S1AEF1_ELYCH/81-329 AC A0A3S1AEF1.1 #=GS K1RCF1_CRAGI/7-243 AC K1RCF1.1 #=GS A0A2V3IZ78_9FLOR/490-761 AC A0A2V3IZ78.1 #=GS A0A261BRY3_9PELO/3-119 AC A0A261BRY3.1 #=GS A0A2S2FBB3_9GAMM/1-265 AC A0A2S2FBB3.1 #=GS A0A260ZBZ3_9PELO/127-313 AC A0A260ZBZ3.1 #=GS A0A0H5S9B3_BRUMA/376-640 AC A0A0H5S9B3.1 #=GS A0A0B2VBJ1_TOXCA/713-974 AC A0A0B2VBJ1.1 #=GS A0A210R2N7_MIZYE/6-268 AC A0A210R2N7.1 A0A2C9KZU3_BIOGL/228-367 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