# STOCKHOLM 1.0
#=GF ID CCDC53
#=GF AC PF10152.10
#=GF DE Subunit CCDC53 of WASH complex
#=GF AU Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF GA 24.5 24.5
#=GF NC 24.4 24.4
#=GF TC 24.7 24.6
#=GF PI DUF2360;
#=GF SE KOGs (KOG4496)
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP Coiled-coil
#=GF RN [1]
#=GF RM 19922875
#=GF RT The Arp2/3 activator WASH controls the fission of endosomes
#=GF RT through a large multiprotein complex.
#=GF RA Derivery E, Sousa C, Gautier JJ, Lombard B, Loew D, Gautreau A;
#=GF RL Dev Cell. 2009;17:712-723.
#=GF DR INTERPRO; IPR019309;
#=GF DR SO; 0001080; coiled_coil;
#=GF CC CCDC53 is a component of the WASH complex, which plays a key
#=GF CC role in the fission of tubules that serve as transport
#=GF CC intermediates during endosome sorting [1].
#=GF SQ 1120
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A0A196S715.1/1801-1839 ----------------------................................---------------------..--...---..............--------.--------.....................................................................................................................................--------.-...--..----.-....---...-.-...-.-.-....-......-....-----.....---.-..-.--..-.-.-.-----...........................................---VPLWQ.......H..P..VYAKYFSMLK.GGVPKKDVEK...KMKDD..GENPAIL-
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A0A196S715.1/2050-2088 ----------------------................................---------------------..--...---..............--------.--------.....................................................................................................................................--------.-...--..----.-....---...-.-...-.-.-....-......-....-----.....---.-..-.--..-.-.-.-----...........................................---VPLWQ.......H..P..VYAKYFSMLK.GGVPKKDVEK...KMKDD..GENPAIL-
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D8LT97.1/1593-1638     ----------------------................................---------------------..--...---..............--------.--------.....................................................................................................................................--------.-...--..----.-....---...-.-...-.-.-....-......-....-----.....---.-..-.--..-.-.-.--VPA...........................................PSMVAAKD.......H..P..DYQKYFKMLR.MGLPRGAALQ...KMATE..GKDQAILD
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A0A225WUH8.1/775-820   ----------------------................................---------------------..--...---..............--------.--------.....................................................................................................................................--------.-...--..----.-....---...-.-...-.-.-....-......-....-----.....---.-..-.--..-.-.-.--ALS...........................................QPQVKVKD.......D..P..AYSKFFKLLE.MGAPADSVKA...KMRMA..GLQGDLLD
B7FZW8.1/676-743       ----------------------................................---------------------..--...---..............--------.--------.....................................................................................................................................--------.-...--..----.-....---...-.-...S.S.S....D......N....KPDAL.....SNT.Q..I.GK..L.S.N.PKSEV...........................................SMELAIKA.......D..P..RFEKYYKMHA.VGLPEGAIRN...ACVRD..GVDASFLD
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G4YU92.1/445-495       ----------------------................................---------------------..--...---..............--------.--------.....................................................................................................................................--------.-...--..----.-....---...-.-...-.-.-....-......-....-----.....---.-..-.--..T.K.E.QTPTP...........................................ASQPAPTS.......G..P..DISKFKKLLS.MGAPLAAVKA...KMTQA..GLDTALLD
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A0A1S3N035.1/30-177    LNQFIVHTVRFLNRFSTVCEEK................................LACISLRIQQIETTLSILEAK..LS...SIP..............GLEDVRVE.GVGQRPAT.....................................................................................................................................EVNGPVAV.V...VP..SQPE.T....PIA...V.G...L.P.P....P......E....ASPNI.....PDP.-..-.--..-.R.A.AEAAG...........................................DSWMTVAK.......D..P..RYARYLKMVQ.VGVPVMAIKN...KMVQE..GLDPKLLD
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A0A341ABA3.1/30-167    LNQFVVHTVQFLNRFSTVCEEK................................LADLSLRIQQIETTLNILDAK..LS...SIP..............GLDDVTFE.VS------.....................................................................................................................................------PV.S...VT..RITN.E....THS...E.T...T.S.E....Q......S....QPNSL.....QDS.G..P.QE..S.-.-.-EVTP...........................................ENILTVAK.......D..P..RYARYLKMVQ.VGVPVMAIRN...KMISE..GLDPDLLE
A0A1S3FDX4.1/30-167    LNQFVVHTVQFLNRFSTVCEEK................................LSDLSLRIQQIETTLNILDAK..LS...SIP..............GLDDVTFE.VS------.....................................................................................................................................--PVSVPN.V...T-..---N.E....LHY...G.T...A.S.E....Q......S....QQNNT.....QDS.G..P.QE..S.-.-.-EVSS...........................................ENILTVAK.......D..P..RYARYLKMVQ.VGVPVMAIRN...KMISE..GLDPDLLE
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A0A2Y9IQD2.1/30-167    LNQFVVHTVQFLNRFSTVCEEK................................LADLSLRIQQIETTLNILDAK..LS...SIP..............GLDDVTFE.V-------.....................................................................................................................................----SPVS.V...PG..V-TK.E....SHS...E.T...T.S.E....K......S....QQNSL.....QDS.G..P.QE..S.-.-.-EVTP...........................................ENILTVAK.......D..P..RYARYLKMVQ.VGVPVMAIRN...KMISE..GLDPDLLE
A0A4W2GFT7.1/30-167    LNQFVVHTVQFLNRFSTVCEEK................................LADLSLRIQQIETTLNILDAK..LS...SIP..............GLDDVTFE.VS------.....................................................................................................................................---PVNVT.R...IT..NGTH.S....EAT...S.E...Q.S.Q....Q......N....SLQDS.....GPQ.E..S.EV..T.-.-.----P...........................................ENILTVAK.......D..P..RYARYLKMVQ.VGVPVMAIRN...KMISE..GLDPDLLE
G1LIA8.1/30-167        LNQFVVHTVQFLNRFSTVCEEK................................LADLSLRIQQIETTLNILDAK..LS...SIP..............GLDEVTFE.VS------.....................................................................................................................................------PV.S...VT..GITK.E....SHS...E.T...T.S.E....K......S....QQNSL.....QDS.G..P.QE..S.-.-.-EVTP...........................................ENILTVAK.......D..P..RYARYLKMVQ.VGVPVMAIRN...KMISE..GLDPDLLE
A0A2K6ELP7.1/30-167    LNQFVVHTVQFLNRFSTVCEEK................................LANLSLRIQQIETTLNILDAK..LS...SIP..............GLDDVTFE.VSPLSVT-.....................................................................................................................................NVTNGPHS.-...--..----.-....E--...-.V...T.S.E....Q......S....QQNST.....QDS.G..P.HE..S.-.-.-EVSA...........................................ENILTVAK.......D..P..RYARYLKMVQ.VGVPVMAIRN...KMISE..GLDPDLLE
A0A2Y9GVA7.1/30-167    LNQFVVHTVQFLNRFSTVCEEK................................LADLSLRIQQIETTLNILDAK..LS...SIP..............GLDDVTFE.VS------.....................................................................................................................................-----PVS.V...T-..GITE.E....SHS...E.T...T.S.E....K......S....QQNSL.....QDS.G..P.QE..S.-.-.-EVTP...........................................ENILTVAK.......D..P..RYARYLKMVQ.VGVPVMAIRN...KMISE..GLDPDLLE
A0A1S3K343.1/30-181    LNHFVIHTSRFLNRFSCVCEEK................................LMHLSTRIQRLETTMNMLETK..IS...SIP..............GLENITAP.ASSAPSSG....................................................................................................................................tADTQAPPG.T...AP..AAPP.A....PPP...A.G...D.S.A....A......P....TAAPN.....A--.E..Q.PA..Q.T.E.EPQPE...........................................KPKMTVSQ.......D..P..RYTKYFKMVT.VGVPAAAVRP...KMLAE..GLNPDLLE
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A0A2U3XIR1.1/30-167    LNQFVVHTVQFLNRFSTVCEEK................................LADLSLRIQQIETTLNILDAK..LS...SIP..............GLDDVTFE.VS------.....................................................................................................................................------PV.S...VT..GITK.E....SHS...E.T...T.S.E....K......S....QQNSL.....QDS.G..P.QE..S.-.-.-EVTP...........................................ENILTVAK.......D..P..RYARYLKMVQ.VGVPVMAIRN...KMISE..GLDPDLLE
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