# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID BROMI #=GF AC PF14961.7 #=GF DE Broad-minded protein #=GF AU Eberhardt R;0000-0001-6152-1369 #=GF GA 25.0 25.0 #=GF NC 22.2 24.9 #=GF TC 26.1 25.7 #=GF SE Jackhmmer:Q96NH3 #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Family #=GF RN [1] #=GF RM 20159594 #=GF RT Broad-minded links cell cycle-related kinase to cilia assembly #=GF RT and hedgehog signal transduction. #=GF RA Ko HW, Norman RX, Tran J, Fuller KP, Fukuda M, Eggenschwiler JT; #=GF RL Dev Cell. 2010;18:237-247. #=GF DR INTERPRO; IPR032735; #=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region; #=GF CC Broad-minded protein (BROMI) interacts with cell cycle-related #=GF CC kinase (CCRK), together these proteins regulate ciliary membrane #=GF CC and axonemal growth [1]. #=GF SQ 139 F1N9K0.2/12-1296 LQSMLRQLLQSVKEKITGAPSVE.CAEEILLHLEETDENFHNYEFVKYLRQYINNTLGSVIEEESEK.CTSTQNQ.TEISGYD..TLVQHVTKKTRESKQYREMMHALKNVMMVVVESLI...NKF.....................EED......RMCN.....K.EL...DS.....K.SK....K..K.C.Q.SDYY..T.DN..YSD...SD.S..SFN....Q.S.Y.TF.M..S..QEQLQLLVEKL.DPIQPKEV.RQEALQMLCL.SPP.SDVLNSEC.WPNLRKHLMMSLSDPDAIFSEKILRFYAKTFSSSPFNMAREVYTSL..AQHLEFYFF..SGE..YS...L-RISSGLDVSNADVNHILKKVRLLNEYQKEAPSSWIRYPEKYMEEIVESTLSLLSV....KHDPN........................HPASPDFLSPIYFLALLDIKAMWFKKWTHAHYSRTVILRL......L.EKK.YKSLINAA.VQQCL...DY.FEYCK...AAV..SKTP..........RV...SG...............FSQ-Q.HLNN......E..QKFF.YTGSELQYIYFVHSLCLLGRLLIYKQGRNLFPVHL...E........NKKD..C.ISL.............TDLL...VLFARLIYYS....P....SY.....SKEAL..T...........AHTDNYSPASLVMEILQVFCDQTGCAADCL...........Y.TDAVMDALLDPLQSLLN.........G..................T.EV.YI........N..CLET....T.L...I.DVADILARIAAAEDGLPVLLYGG..S.K.N.S..A....K.E....SSPTA.........VH...V......IVQFTKKL..LHDDIS....LLSGSELLQ..VVKGAF..IFVCR.......QMYRTCEGLQMLIPYGLHESIGEAWKKASLL...SERVPTP...VT.GA.........DCTS..SISLD..SKN..V..LLWEET..LLDALLNF....SATPKGLFLLHSTGAMSDCVSFMFNSLSKKH.QTNE.REEFGNGVIVAQMATTPTAAVALQSS.GFIKAFITELWALLEC.........GKD......DV...R.IT..QPK...ST...P...VDPI.D.QSCQKSFLYLINLL-TYPAV.FELLSEQDIPNKP......MYSHRE...VPTDIINVIDRIIIV..NSEAKIHSLFNYEQSHIFGLRLLSVLCCELNTLLLLETQYKVSQVLLTAQE.ENVTEASE..........................GPGDFIVDSLSVERNHVLVRINLIGGPQERILPLRAL......E..K.G.SDP.YPWPMFSSF..PLPKCYLA..E..VPRKADFR....Q............DKD..LD..ELIS.I..L...Q.N...PG.GQTEWAEICRRQF..CKIMK...TR...PDII.SG...AILAEL.IEKFVL.HL.S....ESRSNC.YFSI.........G.RYE.....ATDV.D.MK..K..E......SLSSVQQLGIEMTVRYGK.YL.N....LLK.........EH..AE..N..EL..C.FV.....LMNCEQFLK....QQQ...RTVV.SSLRCL....................QGRY...A.....GYDWFASSVFLIMSGDGEKTL....TFLQQFSHLLVSAFLWIPRLHMS...MHLPITT..V..ESGIHPVYFCTA.HYIEMLL.KAELPLVFSAF...H.MSGFTPSQICLQWITQCFWNYMDWSEICHYIATCIFL.GPDYQV..YMCISVFRHLQ..............QDIL.........KHT.EAQDLQ..VF.L.KE.EA.....L.HG..FRV.TDYLEYMESLELIYRPVLLKDMRNI- Q3URV1.2/12-1292 LQAMLRQLFQSVKEKITGAPSLE.CAEEILLRLEETDENFHNYEFVKYLRQHICNMLGSMIEEEMEK.CTSDQNQ.GEDSGYD..TVVQHVTKRTQESKEYKEMMHSLKNIMMVVVEAMI...NKF.....................EED......ETRS.....E.DR...QR.....K.M-....-..-.Q.S.GSCC..T.DN..CSD...SD.S..SFN....Q.S.Y.KF.-..C..QGKLRLILDQL.DPGQPKEV.RYEALQTLCS.APP.SDVLSCEN.WTTLCEKLTTSLSDPDPMFTDRILKFYAQTFTLSPLHMTKEIYTSL..AKYLEVYFL..SRE..NH...LPTLSTGVDITSPNVTRLLKKVRLLNEYQKEAPSFWIRHPEKYMEEIVESTLSLLSV....KHEQS........................HLVPQKILDPIYFFALVDTKAVWFKKWMHAYYSRTAVLRL......L.EKK.YKCLITTA.VQQCV...QY.LELCE...AMK..ADEI..........--...--...............LRHPK.HCGT......K..QKSFyYSGQELQYIYFIHSLCLLGRLLIYTQGRKLFPIKL...K........NRKD..S.VSL.............TNLL...VLFTQLIYYS....P....SC.....PKMTS..I...........MCSENYSPASMVTDVLRMLCDQKECAVECL...........Y.NSTVTEALLLPIHNLTK.........G..................T.AA.AP........D..CSET....A.L...I.HIADILARIASVEEGLILLLYGE..N.M.N.S..S....E.E....ESLTG.........AH...I......IAKFSKKL..LEEDIS....IFSGSEMLP..VVKGAF..ISVCR.......QIYGTCEGLQVLLPYGLHESIAKAWKKTSLL...SERIPTP...VE.GS.........DSVS..SVSQV..SPN..S..VAWEDN..LLDDLLNF....AATPKGLLLLQRTGAINECVTFMLSQYAKKP.QVNR.QKKFGYEVLVVQVASTAAGAVALQNS.GFISALITELWSNLEC.........GRD......DV...R.LT..HPR...AT...P...VDPI.D.RSCQKSFLALVNLL-SYPAV.YELTANQELPNKA......EYSLRE...VPTCIIDIMDRLIVL..NSEAKIRSLLNYEQSHTFGLRLLSVVCCDLDALLLLEAQYQVSNMLLHAQE.ENTFEISE..........................NHRNFIIDGLSVERNHVLVRINLIGGPSERILPPRML......E..K.G.DDP.YPWPMFSSY..PLPHCYQS..E..GPRSADLK....Q............DND..IG..NLLS.C..F...K.M...SD.KQTEWIENCRRQF..CKTMK...SK...PDAV.HG...SALGEL.LEKFVL.LL.T....ENPSEC.YFPS.........V.EYT.....ATDA.N.VK..N..E......SLSSVQQLGMKMTVRYGR.FL.N....LLK.........DG..AE..N..EL..A.LV.....LKHCEKFLK....QQQ...SPVT.SSLLCL....................QGNY...A.....GHDWFVSSLFMIMLGDKGKTF....HFLQHFSRLLTSAFLWVPRLHNS...RYLPVDT..L..GTGIHPIYFCSA.HYIEMLL.KAEVPLVFSAF...H.MSGFAPSQICLQWITQCFWNYLDWIEICHYIATCVVL.GPDYQV..YVCIAVLKHLQ..............RDIL.........QHT.QTQDLQ..VF.L.KE.EA.....L.HG..FRV.SNYFEYMENLEQNYRPVLLRDMRSIR Q5RHR6.2/12-1293 LQTLLRKLLKSVKDRISGAPSVE.CAEEILLHLEETDKNFHNYEFVKYLREYVESSLGAVIEVETEN.FTKGEGH.AVGSGQD..TLVHAVTKNTRESTQYKQMMQTLKQTMMMVVESLI...NKF.....................EED......QMKR.....E.EM...DR.....K.IQ....H..Q.Q.S.ISQY..A.DN..CSD...SD.S..SFN....Q.S.Y.AF.I..K..HEQLQVIAEKL.DPGRPREV.RWEALQSLCH.APP.SDVLSCES.WTGLRRNLSTALTDPDPELSDKVLQFFAKTFSSSPLNVTKDIYASIgnTKTLEAHFL..YHK..LS...FPSGTTSIDANRPDMARLLKQMRLMNDFQKEVTTFWIRHPEKYMEEIIENTLSLLAL....HSEQGm......................sSPGSEKSLEPIHLISLLDIKATWFKKWMHGYYSRTVVLRL......L.ERK.YKSLIVNA.LQQCI...YY.FDSCD...ALS..EETL..........EM...IH...............SLEHQ.QIGP......A..GRTL.YTSKELEFVYFVHSLCVLGRLVMYTNGRKFFPIKV...K........KRRD..P.VTL.............TDLV...VILINIMYQH....P...kPS.....CGET-..-...........ALADTMSPTNLVMEVLRTLCDRTECAVECL...........Y.QIPVIETLLAPLITLLT.........G..................K.LP.KL........N..SMES....A.L...T.HTADTLARIATTERGLSLLLYDR..N.L.V.S..A....E.G....ESISA.........AH...L......IVQFTQKL..LAKELQ....VENSS----..SMSGAF..IFVCR.......QMYNTCEGLQVLRPYSLHECIAQAWRTTSSM...SERVPTP...VP.GA.........-PPA..LASQE..LQS..V..VAWEEM..LLDNLLNF....AATPKGLLLLQQTGAINECVTYMFSRFTKKL.QVSR.CEKFGYGVMVTQVATTAPGIVALQSS.GFVQTIVVELWSALEC.........GRE......DV...R.VV..HPK...ST...P...MDPI.D.RSCLKSFLSLVNLLSSPHAV.WELLGHRALPNKT......EYNLRE...MATSVLDLMDRLIII..NSDAKIHSLFNYEQSHTFGLRLLSVLCCNLDSFLLLESQYKLTDLLLQGQR.DNVTEPPS..........................GEGEFIIDGLSVERNHILVRICAVGGPSERKLPPRAL......Q..K.G.NDP.YPWPMVSTY..PLPKYYIF..D..VPKILRTK....Q............ESE..IG..AFLT.S..S...K.E...TE.RDASWMDDCRRQF..CKIMA...TK...SNTL.TG...YVLADL.LEMVVL.HL.S....SSSNDC.FFPP.........A.EYK.....VVDN.S.VK..T..R......SLSSVEQLGVEISLRYGK.FL.K....LLR.........ED..SE..Q..DL..C.LL.....LKHCQEFLS....QQR...VKVT.SELC--....................--GY...P.....GHDWFASTVFLLMHGDVGRSL....SLLLRFSRLLPSAFLWPPRLHSS...VHLPIEI..A..QSAIHPIYSCTA.HYVEMLL.KAEVPLVFSAF...R.MSGFTPSQICVQWLGQCFWNYLDWPEICQYVTTCVIM.GPDYQV..YMCVSALRHLQ..............QDIL.........QHT.QTQDLQ..VF.L.KE.EP.....I.QG..FRV.SNYLEYMEGLERSYRSMVLSDMRSI- D4A050.3/12-1297 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Q96NH3.4/12-857 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Q96NH3.4/857-1253 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F6ZW95.2/12-1302 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F6ZVZ2.2/12-857 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C3YGB8.1/201-438 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C3YGB8.1/439-644 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D8LGY7.1/400-517 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