# STOCKHOLM 1.0
#=GF ID   SOBP
#=GF AC   PF15279.7
#=GF DE   Sine oculis-binding protein
#=GF AU   Eberhardt R;0000-0001-6152-1369
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF AU   Hetherington K;
#=GF SE   Jackhmmer:Q9Y5P3
#=GF GA   27.10 27.10;
#=GF TC   27.10 27.10;
#=GF NC   26.70 26.70;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   17618476
#=GF RT   Autosomal recessive mental retardation syndrome with anterior
#=GF RT   maxillary protrusion and strabismus: MRAMS syndrome.
#=GF RA   Basel-Vanagaite L, Rainshtein L, Inbar D, Gothelf D, Hennekam R,
#=GF RA   Straussberg R;
#=GF RL   Am J Med Genet A. 2007;143:1687-1691.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   21035105
#=GF RT   SOBP is mutated in syndromic and nonsyndromic intellectual
#=GF RT   disability and is highly expressed in the brain limbic system.
#=GF RA   Birk E, Har-Zahav A, Manzini CM, Pasmanik-Chor M, Kornreich L,
#=GF RA   Walsh CA, Noben-Trauth K, Albin A, Simon AJ, Colleaux L, Morad
#=GF RA   Y, Rainshtein L, Tischfield DJ, Wang P, Magal N, Maya I,
#=GF RA   Shoshani N, Rechavi G, Gothelf D, Maydan G, Shohat M,
#=GF RA   Basel-Vanagaite L;
#=GF RL   Am J Hum Genet. 2010;87:694-700.
#=GF DR   INTERPRO; IPR026092;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   SOBP is associated with syndromic and nonsyndromic intellectual
#=GF CC   disability. It carries a zinc-finger of the zf-C2H2 type at the
#=GF CC   N-terminus, and a highly characteristic C-terminal PhPhPhPhPhPh
#=GF CC   motif. The deduced 873-amino acid protein contains an N-terminal
#=GF CC   nuclear localisation signal (NLS), followed by 2 FCS-type zinc
#=GF CC   finger motifs, a proline-rich region (PR1), a putative
#=GF CC   RNA-binding motif region, and a C-terminal NLS embedded in a
#=GF CC   second proline-rich motif.  SOBP is expressed in various human
#=GF CC   tissues, including developing mouse brain at embryonic day 14.
#=GF CC   In postnatal and adult mouse brain SOBP is expressed in all
#=GF CC   neurons, with intense staining in the limbic system. Highest
#=GF CC   expression is in layer V cortical neurons, hippocampus, pyriform
#=GF CC   cortex, dorsomedial nucleus of thalamus, amygdala, and
#=GF CC   hypothalamus. Postnatal expression of SOBP in the limbic system
#=GF CC   corresponds to a time of active synaptogenesis [2]. the family
#=GF CC   is also referred to as Jackson circler, JXC1. In seven affected
#=GF CC   siblings from a consanguineous Israeli Arab family with mental
#=GF CC   retardation, anterior maxillary protrusion, and strabismus
#=GF CC   mutations were found in this protein [1,2].
#=GF SQ   550
#=GS A0A493T810_ANAPP/192-511  AC A0A493T810.1
#=GS A0A444TCE3_ARMVU/196-545  AC A0A444TCE3.1
#=GS A0A3P8RLN7_AMPPE/250-561  AC A0A3P8RLN7.1
#=GS A0A3P9NDI2_POERE/234-544  AC A0A3P9NDI2.1
#=GS A0A2Y9DYD5_TRIMA/3-200    AC A0A2Y9DYD5.1
#=GS A0A443REM3_9ACAR/178-529  AC A0A443REM3.1
#=GS A0A2I4CY30_9TELE/377-510  AC A0A2I4CY30.1
#=GS H3C1M2_TETNG/342-510      AC H3C1M2.1
#=GS A0A384AUS4_BALAS/224-543  AC A0A384AUS4.1
#=GS A0A1W4V0R2_DROFC/292-628  AC A0A1W4V0R2.1
#=GS A0A3Q2VT60_HAPBU/226-537  AC A0A3Q2VT60.1
#=GS M4B0H8_XIPMA/90-260       AC M4B0H8.1
#=GS A0A3Q4HWU2_NEOBR/223-372  AC A0A3Q4HWU2.1
#=GS A0A3Q2HKG7_HORSE/224-543  AC A0A3Q2HKG7.1
#=GS A0A2U9CLA7_SCOMX/226-535  AC A0A2U9CLA7.1
#=GS A0A455C384_PHYMC/271-590  AC A0A455C384.1
#=GS I3MZK3_ICTTR/194-513      AC I3MZK3.2
#=GS A0A3B4ZEZ1_9TELE/241-552  AC A0A3B4ZEZ1.1
#=GS Q7PZA5_ANOGA/218-535      AC Q7PZA5.4
#=GS A0A493SYD5_ANAPP/224-543  AC A0A493SYD5.1
#=GS W5NIN6_LEPOC/228-538      AC W5NIN6.1
#=GS G1Q861_MYOLU/224-543      AC G1Q861.1
#=GS A0A3B3SU09_9TELE/1-286    AC A0A3B3SU09.1
#=GS A0A087YSL9_POEFO/90-256   AC A0A087YSL9.2
#=GS A0A1W4WQE9_AGRPL/203-351  AC A0A1W4WQE9.1
#=GS B4H5A6_DROPE/249-590      AC B4H5A6.1
#=GS W5PMV7_SHEEP/358-461      AC W5PMV7.1
#=GS A0A2I4CY55_9TELE/230-377  AC A0A2I4CY55.1
#=GS A0A1I8M9A9_MUSDO/251-632  AC A0A1I8M9A9.1
#=GS A0A2U3TVD1_DANRE/223-350  AC A0A2U3TVD1.1
#=GS A0A0L7LHH4_9NEOP/42-330   AC A0A0L7LHH4.1
#=GS A0A1S3R5R4_SALSA/129-437  AC A0A1S3R5R4.1
#=GS A0A3P9CPV0_9CICH/348-512  AC A0A3P9CPV0.1
#=GS A0A1J1IIF9_9DIPT/158-292  AC A0A1J1IIF9.1
#=GS A0A2I3MW15_PAPAN/224-543  AC A0A2I3MW15.1
#=GS A0A226PKX9_COLVI/1-263    AC A0A226PKX9.1
#=GS D6WA41_TRICA/242-340      AC D6WA41.1
#=GS E9GN80_DAPPU/141-450      AC E9GN80.1
#=GS A0A2Y9DWZ7_TRIMA/5-250    AC A0A2Y9DWZ7.1
#=GS A0A452GF40_9SAUR/224-543  AC A0A452GF40.1
#=GS A0A1S3R742_SALSA/240-548  AC A0A1S3R742.1
#=GS A0A3B4DX72_PYGNA/124-271  AC A0A3B4DX72.1
#=GS A0A1S3S6X3_SALSA/228-395  AC A0A1S3S6X3.1
#=GS W5PMV7_SHEEP/224-374      AC W5PMV7.1
#=GS G1NLA1_MELGA/194-512      AC G1NLA1.2
#=GS M7BJC4_CHEMY/1-284        AC M7BJC4.1
#=GS A0A3Q1GAE1_9TELE/194-505  AC A0A3Q1GAE1.1
#=GS A0A2A4JMS5_HELVI/88-392   AC A0A2A4JMS5.1
#=GS W5NMN8_LEPOC/1-290        AC W5NMN8.1
#=GS A0A182W1V8_9DIPT/236-604  AC A0A182W1V8.1
#=GS A0A2A3E9Y1_APICC/220-545  AC A0A2A3E9Y1.1
#=GS H0XGU0_OTOGA/87-250       AC H0XGU0.1
#=GS F1MFE9_BOVIN/5-250        AC F1MFE9.2
#=GS A0A1U7QG76_MESAU/224-543  AC A0A1U7QG76.1
#=GS A0A182FUM7_ANOAL/270-523  AC A0A182FUM7.1
#=GS A0A3Q0RRN6_AMPCI/349-513  AC A0A3Q0RRN6.1
#=GS H0ZPJ7_TAEGU/83-402       AC H0ZPJ7.1
#=GS A0A087SYA7_9ARAC/409-570  AC A0A087SYA7.1
#=GS A0A498M0A0_LABRO/158-290  AC A0A498M0A0.1
#=GS A0A3B3UZD5_9TELE/226-536  AC A0A3B3UZD5.1
#=GS B4JVS0_DROGR/242-602      AC B4JVS0.1
#=GS A0A226PSW7_COLVI/201-520  AC A0A226PSW7.1
#=GS A0A401NKD8_SCYTO/84-398   AC A0A401NKD8.1
#=GS A0A3Q0IZZ8_DIACI/1-128    AC A0A3Q0IZZ8.1
#=GS A0A0A0B3F0_CHAVO/83-402   AC A0A0A0B3F0.1
#=GS F6U6M7_MACMU/51-370       AC F6U6M7.2
#=GS W5LPN4_ASTMX/256-571      AC W5LPN4.2
#=GS A0A2J8W488_PONAB/5-250    AC A0A2J8W488.1
#=GS A0A182HHC4_ANOAR/256-631  AC A0A182HHC4.1
#=GS A0A1S3AQ45_ERIEU/4-200    AC A0A1S3AQ45.1
#=GS G3P4S2_GASAC/1-140        AC G3P4S2.1
#=GS A0A340WI64_LIPVE/86-250   AC A0A340WI64.1
#=GS G5B5R7_HETGA/83-250       AC G5B5R7.1
#=GS F1PDC8_CANLF/194-513      AC F1PDC8.2
#=GS Q95TY2_DROME/278-603      AC Q95TY2.1
#=GS A0A452CB26_BALAS/84-248   AC A0A452CB26.1
#=GS A0A226NKM8_CALSU/224-543  AC A0A226NKM8.1
#=GS A0A3P9D0F8_9CICH/102-264  AC A0A3P9D0F8.1
#=GS A0A452RRT7_URSAM/1-89     AC A0A452RRT7.1
#=GS G1U0M6_RABIT/224-520      AC G1U0M6.1
#=GS A0A1S3APZ5_ERIEU/86-250   AC A0A1S3APZ5.1
#=GS T1EZ92_HELRO/1-298        AC T1EZ92.1
#=GS A0A2K6UDG7_SAIBB/224-543  AC A0A2K6UDG7.1
#=GS A0A2Y9MH58_DELLE/85-250   AC A0A2Y9MH58.1
#=GS SOBP_HUMAN/224-543        AC A7XYQ1.2
#=GS A0A060W7D3_ONCMY/233-542  AC A0A060W7D3.1
#=GS A0A091F146_CORBR/83-402   AC A0A091F146.1
#=GS A0A1S3GFF5_DIPOR/3-200    AC A0A1S3GFF5.1
#=GS A0A3B4DWW3_PYGNA/262-577  AC A0A3B4DWW3.1
#=GS A0A1S3R5K0_SALSA/264-572  AC A0A1S3R5K0.1
#=GS A0A3Q1BB17_AMPOC/99-268   AC A0A3Q1BB17.1
#=GS A0A151MJH9_ALLMI/224-543  AC A0A151MJH9.1
#=GS U3KB29_FICAL/224-543      AC U3KB29.1
#=GS A0A482VL59_9CUCU/178-263  AC A0A482VL59.1
#=GS A0A3B3BJ42_ORYME/192-343  AC A0A3B3BJ42.1
#=GS B4K2J5_DROGR/194-292      AC B4K2J5.1
#=GS A0A482VL59_9CUCU/41-203   AC A0A482VL59.1
#=GS A0A3Q3B120_KRYMA/230-375  AC A0A3Q3B120.1
#=GS A0A1S3MY09_SALSA/137-306  AC A0A1S3MY09.1
#=GS G3UFM6_LOXAF/224-534      AC G3UFM6.1
#=GS A0A3Q3C6M1_HAPBU/234-545  AC A0A3Q3C6M1.1
#=GS D2I262_AILME/5-250        AC D2I262.1
#=GS A7XYK4_TETNG/241-409      AC A7XYK4.1
#=GS T1KML7_TETUR/89-417       AC T1KML7.1
#=GS A0A3Q7WQZ1_URSAR/224-543  AC A0A3Q7WQZ1.1
#=GS A0A3B3DE28_ORYME/234-545  AC A0A3B3DE28.1
#=GS A0A1S3JKQ9_LINUN/146-496  AC A0A1S3JKQ9.1
#=GS A0A3P9A5L7_ESOLU/227-526  AC A0A3P9A5L7.1
#=GS F6TM42_MONDO/1-262        AC F6TM42.1
#=GS A0A3Q2C8G1_CYPVA/230-382  AC A0A3Q2C8G1.1
#=GS A0A3B5KHB8_TAKRU/353-518  AC A0A3B5KHB8.1
#=GS A0A182XGQ7_ANOQN/254-634  AC A0A182XGQ7.1
#=GS A0A3B3UZ80_9TELE/226-536  AC A0A3B3UZ80.1
#=GS A0A2D0QNZ5_ICTPU/230-549  AC A0A2D0QNZ5.1
#=GS A0A3Q1ERQ4_9TELE/234-545  AC A0A3Q1ERQ4.1
#=GS A0A1U7TM00_TARSY/4-200    AC A0A1U7TM00.1
#=GS A0A3Q1D6D7_AMPOC/10-321   AC A0A3Q1D6D7.1
#=GS A0A2D0SIL6_ICTPU/104-275  AC A0A2D0SIL6.1
#=GS A0A3Q7UIN4_URSAR/5-250    AC A0A3Q7UIN4.1
#=GS A0A2I4CY55_9TELE/384-517  AC A0A2I4CY55.1
#=GS A0A3Q3A657_KRYMA/226-537  AC A0A3Q3A657.1
#=GS A0A096LT32_POEFO/1-311    AC A0A096LT32.1
#=GS A0A484ARQ4_DRONA/46-393   AC A0A484ARQ4.1
#=GS A0A2I4ALU7_9TELE/57-260   AC A0A2I4ALU7.1
#=GS A0A3Q7SV20_VULVU/16-209   AC A0A3Q7SV20.1
#=GS A0A2U3YJ90_LEPWE/1-320    AC A0A2U3YJ90.1
#=GS A0A3Q0CX05_MESAU/4-200    AC A0A3Q0CX05.1
#=GS A0A182K5A6_9DIPT/22-385   AC A0A182K5A6.1
#=GS A0A3Q1ERQ0_9TELE/226-537  AC A0A3Q1ERQ0.1
#=GS A0A093HIB6_STRCA/83-402   AC A0A093HIB6.1
#=GS B4HNT4_DROSE/273-602      AC B4HNT4.1
#=GS A0A3B4XK08_SERLL/101-263  AC A0A3B4XK08.1
#=GS A0A3B4V2R7_SERDU/226-537  AC A0A3B4V2R7.1
#=GS I3KBJ0_ORENI/223-369      AC I3KBJ0.1
#=GS A0A226E599_FOLCA/704-980  AC A0A226E599.1
#=GS A0A3Q1BCM5_AMPOC/186-332  AC A0A3Q1BCM5.1
#=GS A0A3P8QF83_ASTCA/104-266  AC A0A3P8QF83.1
#=GS A7XYJ3_XENTR/224-541      AC A7XYJ3.1
#=GS A0A337SCK9_FELCA/192-511  AC A0A337SCK9.1
#=GS A0A3B4DX27_PYGNA/254-569  AC A0A3B4DX27.1
#=GS A0A3Q3MHL3_9TELE/226-537  AC A0A3Q3MHL3.1
#=GS L5KNY2_PTEAL/4-250        AC L5KNY2.1
#=GS A0A3B3YSB1_9TELE/323-484  AC A0A3B3YSB1.1
#=GS A0A091V8R8_OPIHO/83-402   AC A0A091V8R8.1
#=GS A0A3Q0RUU9_AMPCI/237-548  AC A0A3Q0RUU9.1
#=GS A0A3Q3G804_9LABR/202-516  AC A0A3Q3G804.1
#=GS A0A2Y9KRZ5_ENHLU/224-543  AC A0A2Y9KRZ5.1
#=GS J9NW63_CANLF/5-250        AC J9NW63.1
#=GS A0A0P7U6M9_SCLFO/20-289   AC A0A0P7U6M9.1
#=GS I3KTY8_ORENI/226-537      AC I3KTY8.1
#=GS A0A1S3SQ65_SALSA/263-574  AC A0A1S3SQ65.1
#=GS A0A087YN22_POEFO/363-521  AC A0A087YN22.2
#=GS A0A3Q1JJL1_ANATE/252-560  AC A0A3Q1JJL1.1
#=GS A0A1B0BUE6_9MUSC/56-390   AC A0A1B0BUE6.1
#=GS L9JHS6_TUPCH/43-367       AC L9JHS6.1
#=GS A0A384D904_URSMA/224-543  AC A0A384D904.1
#=GS A0A1L8HG16_XENLA/1-268    AC A0A1L8HG16.1
#=GS A0A3P8R6K2_ASTCA/226-537  AC A0A3P8R6K2.1
#=GS G3WCZ8_SARHA/1-262        AC G3WCZ8.1
#=GS A0A3Q3D1D8_HAPBU/104-266  AC A0A3Q3D1D8.1
#=GS A0A3Q3LJK4_9TELE/230-375  AC A0A3Q3LJK4.1
#=GS I3KBJ1_ORENI/228-374      AC I3KBJ1.1
#=GS A0A1S3SQ85_SALSA/223-534  AC A0A1S3SQ85.1
#=GS A0A2Y9JRP5_ENHLU/6-200    AC A0A2Y9JRP5.1
#=GS G5E5M4_BOVIN/224-543      AC G5E5M4.1
#=GS A0A3Q1E9P3_9TELE/101-268  AC A0A3Q1E9P3.1
#=GS A0A1S3S6X3_SALSA/358-523  AC A0A1S3S6X3.1
#=GS A0A096NR72_PAPAN/224-543  AC A0A096NR72.2
#=GS A0A2Y9S1F2_PHYMC/224-543  AC A0A2Y9S1F2.1
#=GS I3KBJ1_ORENI/350-517      AC I3KBJ1.1
#=GS A0A3Q3B120_KRYMA/390-529  AC A0A3Q3B120.1
#=GS A0A3Q4HWU2_NEOBR/348-512  AC A0A3Q4HWU2.1
#=GS A0A3B4CV47_PYGNA/259-402  AC A0A3B4CV47.1
#=GS B4N5Q1_DROWI/245-568      AC B4N5Q1.2
#=GS A0A093G549_DRYPU/83-402   AC A0A093G549.1
#=GS A0A3B5RAM8_XIPMA/325-484  AC A0A3B5RAM8.1
#=GS A0A2U3Y2T0_LEPWE/5-200    AC A0A2U3Y2T0.1
#=GS A0A2J7PE21_9NEOP/64-387   AC A0A2J7PE21.1
#=GS A0A3P8R6C3_ASTCA/234-545  AC A0A3P8R6C3.1
#=GS A0A3Q7U6Z1_URSAR/2-178    AC A0A3Q7U6Z1.1
#=GS A0A1S3SQ68_SALSA/263-574  AC A0A1S3SQ68.1
#=GS A7XYI3_MONDO/224-543      AC A7XYI3.1
#=GS H2QTH9_PANTR/224-543      AC H2QTH9.2
#=GS A0A1S3SQ83_SALSA/255-566  AC A0A1S3SQ83.1
#=GS A0A182L4V4_9DIPT/243-618  AC A0A182L4V4.1
#=GS A0A3Q1F0I5_9TELE/230-379  AC A0A3Q1F0I5.1
#=GS A0A0L7RII0_9HYME/147-296  AC A0A0L7RII0.1
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