# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID S100PBPR #=GF AC PF15427.7 #=GF DE S100P-binding protein #=GF AU Coggill P;0000-0001-5731-1588 #=GF SE Jackhmmer:Q96BU1 #=GF GA 27.00 26.40; #=GF TC 38.60 26.40; #=GF NC 25.70 25.40; #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Family #=GF RN [1] #=GF RM 15632002 #=GF RT Expression of S100P and its novel binding partner S100PBPR in #=GF RT early pancreatic cancer. #=GF RA Dowen SE, Crnogorac-Jurcevic T, Gangeswaran R, Hansen M, #=GF RA Eloranta JJ, Bhakta V, Brentnall TA, Luttges J, Kloppel G, #=GF RA Lemoine NR; #=GF RL Am J Pathol. 2005;166:81-92. #=GF RN [2] #=GF RM 16129886 #=GF RT Transition from non-motile behaviour to directed migration #=GF RT during early PGC development in zebrafish. #=GF RA Blaser H, Eisenbeiss S, Neumann M, Reichman-Fried M, Thisse B, #=GF RA Thisse C, Raz E; #=GF RL J Cell Sci. 2005;118:4027-4038. #=GF RN [3] #=GF RM 18089492 #=GF RT Usefulness of S100P in diagnosis of adenocarcinoma of pancreas #=GF RT on fine-needle aspiration biopsy specimens. #=GF RA Deng H, Shi J, Wilkerson M, Meschter S, Dupree W, Lin F; #=GF RL Am J Clin Pathol. 2008;129:81-88. #=GF DR INTERPRO; IPR026097; #=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region; #=GF CC S100PBPR is a family of proteins found in eukaryotes, and #=GF CC localised to cell nuclei where S100P is also present, and the #=GF CC two proteins co-immunoprecipitate. S100P is a member of the S100 #=GF CC family of calcium-binding proteins and there have been several #=GF CC recent reports of its over-expression in pancreatic ductal #=GF CC adenocarcinoma. In situ hybridisation shows S100PBPR transcripts #=GF CC to be found in islet cells but not duct cells of the healthy #=GF CC pancreas. An interaction between S100P and S100PBPR may be #=GF CC involved in early pancreatic cancer. #=GF SQ 281 E2RNK1.2/21-407 NAPFS.WG..SLDEDGLDDSLLDLSEGEEDDGHFSFTEEDIQELLK.....DDDLSNEHFSW..G.G.G.LL.KDN.-RHVE..KGGKG.N..EILLDTSQEK..NSLYSLGPVAET..P.GLLKLPQLSTSVGNGPT...P.....TKPLNRH.......F..ALEKNLIK.....ITVV.....APFD..PTVCDAVLDKDKT....DSSKDTEK.......PSSLGE...EMRKG.G.LSPNENKLCSESEGISPSNSAWDAPP..LSSPSD........................NDFEQTVSDKNMPDSK.RPTPV.FS....QIL.DHSETPN..TGSSW..KN-.....GSHKSN..CE....V....RF.PVVSSSS.....NKD....VLDKD...SGKL...K.......VNE.R...R.LGKVIP.VL.Q.AK..RRT..N..V.P.T.F.S.QS.DL..EKQK.ESYLKEVIAHI.E.HPKDT.NQGA..........LGELYALMGQV....HHM....Q....N....PKWQHPSDLTMRNY.A.RFRQKPLQRYSLTQWVDRNM.R.T.HHRFQRL A0A3Q7USE2.1/21-407 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