# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID TrkH #=GF AC PF02386.18 #=GF DE Cation transport protein #=GF AU Eberhardt R;0000-0001-6152-1369 #=GF GA 20.7 20.7 #=GF NC 20.5 20.6 #=GF TC 20.7 20.7 #=GF SE Pfam-B_529 (release 5.2) #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Family #=GF WK Bacterial_potassium_transporter #=GF WK Potassium_transporter_family #=GF CL CL0030 #=GF RN [1] #=GF RM 8948101 #=GF RT Sequencing analysis of a 40.2 kb fragment of yeast chromosome X #=GF RT reveals 19 open reading frames including URA2 (5' end), TRK1, #=GF RT PBS2, SPT10, GCD14, RPE1, PHO86, NCA3, ASF1, CCT7, GZF3, two #=GF RT tRNA genes, three remnant delta elements and a Ty4 transposon. #=GF RA Cziepluch C, Kordes E, Pujol A, Jauniaux JC; #=GF RL Yeast 1996;12:1471-1474. #=GF RN [2] #=GF RM 7896723 #=GF RT TrkH and its homolog, TrkG, determine the specificity and #=GF RT kinetics of cation transport by the Trk system of Escherichia #=GF RT coli. #=GF RA Schlosser A, Meldorf M, Stumpe S, Bakker EP, Epstein W; #=GF RL J Bacteriol 1995;177:1908-1910. #=GF RN [3] #=GF RM 7896723 #=GF RT TrkH and its homolog, TrkG, determine the specificity and #=GF RT kinetics of cation transport by the Trk system of Escherichia #=GF RT coli. #=GF RA Schlosser A, Meldorf M, Stumpe S, Bakker EP, Epstein W; #=GF RL J Bacteriol 1995;177:1908-1910. #=GF RN [4] #=GF RM 10629185 #=GF RT Trk1 and Trk2 define the major K(+) transport system in fission #=GF RT yeast. #=GF RA Calero F, Gomez N, Arino J, Ramos J; #=GF RL J Bacteriol 2000;182:394-399. #=GF DR INTERPRO; IPR003445; #=GF DR TC; 2.A.38; #=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region; #=GF CC This family consists of various cation transport proteins (Trk) #=GF CC and V-type sodium ATP synthase subunit J or translocating #=GF CC ATPase J EC:3.6.1.34. These proteins are involved in active #=GF CC sodium up-take utilising ATP in the process. TrkH a member of #=GF CC the family Swiss:P76769 from E. coli is a hydrophobic membrane #=GF CC protein and determines the specificity and kinetics of cation #=GF CC transport by the TrK system in E. coli [3]. #=GF SQ 11729 P12685.1/625-1180 -KPNFRKRGW.N.NK.I.F.E..H....G...P..Y..A..S...D....S..D.RN....YP.D.N..S..N..TG..N.S..I.L...H...YAES..I...L.HH.DGS..HKN..GS...........EE.A.S.S...D.S...................NENIYSTNGGSDHNGLNN.....Y.....P............T.............Y............N......DDe...........eGY.Y..G.L....HFDTDYDldpr.............................................hdlskGSGK....--..-..-....-....-....T....Y....L....S...W...qP..T..I.G....................R.N....S...N..F...L...G.......L........T.....R..........A........Q..........K.......D.............E........L.....G.........G.............V.........E..............Y........R.......A.............I.....K.....L..L.........C.T...I...........L...........V................V...Y....Y...V....G.W.H..I..V..A...F.V..M....L.V......P..W....I.....I.....L...K...K...H...Y..S..E..V...............................................................................................V...R....D....D.....G......V....S...P...T...W..................................W.G.FWT....A....M....SAF....ND.LG...L...T....L......T...........P......N.........S.......M...M........S.........F......N......K..A..................VYP.L.I.V.MI.W.F.IIIG.N....T.G.F.....P.....I......L.......L...R...........C.........I....I....W....I...M....F......K.I..S..P..D...L.......................SQ.M...R.....E....S........L......G....F.....L...L...D........H....P....R...R......C....F......T....L....L..F....P...K..A...A...T..W...W.L...L.L..T...L.A.........G....L...N...I..........T..D.W..I......L...F..I..I.L.DF..................................................................G.S.T.V..V.....K..S....L....S...K..G....Y...R...V...L.V....G....L....F.Q.S.V.S.T.R.TA.G...F......S......V...........V.......D......L......S......Q......L....H......P......S....I.....Q...........V.....S.....Y.M..L.M.....M.....Y..V..SV.L.....P.-.-.............L......A.I.........S......IRRTN.V...Y....E......E...Q.S.L.G...LY....gD.....M....G....G..E...P...E...D...T....dTEddgndedddeeneshegqssqrs..................................................................................................................................................ssnnnnnnnrkkkkkkktenpneiS.T...KS....F.....I......G......A.....H....L....R....K.....Q....L.....S....F...D....L......W.F............L...F...L...G...L...F....I.....I..........C.....I.............C...............E............G................D.................K......I.......K...........D............V........Q..........E..............P...............N................F.............N........I..F...A...I......L...........F...E....IV............SAY...GTV.G.............L................S.........L.......G..yP...dT................N............Q..............S.............F.............S...............R.............Q.............F.............T..............T.L...S.............K...LV.....I...IAMLIRGKNR...GL..P...Y...S..L.D.R..A.I.ILPSDRLEHI P28584.1/302-845 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Q10065.1/355-856 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P47946.2/318-814 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J7S5U8.1/752-1187 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H2AWP9.1/603-1042 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Q6FL73.1/799-1299 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G0V7T6.1/705-1148 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C4JMB4.1/373-765 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A0A2I2FHL6.1/258-644 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