# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID PAF-AH_p_II #=GF AC PF03403.14 #=GF DE Platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform II #=GF AU Mifsud W;0000-0002-9805-6461 #=GF SE Pfam-B_3469 (release 6.6) #=GF GA 19.80 19.80; #=GF TC 19.80 19.80; #=GF NC 19.70 19.70; #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Domain #=GF RN [1] #=GF RM 9645224 #=GF RT The structure and function of platelet-activating factor #=GF RT acetylhydrolases. #=GF RA Derewenda ZS, Derewenda U; #=GF RL Cell Mol Life Sci 1998;54:446-455. #=GF RN [2] #=GF RM 9218411 #=GF RT Platelet-activating factor acetylhydrolases. #=GF RA Stafforini DM, McIntyre TM, Zimmerman GA, Prescott SM; #=GF RL J Biol Chem 1997;272:17895-17898. #=GF DR INTERPRO; IPR005065; #=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain; #=GF CC Platelet-activating factor acetylhydrolase (PAF-AH) is a #=GF CC subfamily of phospholipases A2, responsible for inactivation of #=GF CC platelet-activating factor through cleavage of an acetyl group. #=GF CC Three known PAF-AHs are the brain heterotrimeric PAF-AH Ib, #=GF CC whose catalytic beta and gamma subunits are aligned in #=GF CC Pfam:PF02266, the extracellular, plasma PAF-AH (pPAF-AH), and #=GF CC the intracellular PAF-AH isoform II (PAF-AH II). This family #=GF CC aligns pPAF-AH and PAF-AH II, whose similarity was previously #=GF CC noted. #=GF SQ 4283 #=GS A0A2K6Q6X9_RHIRO/48-416 AC A0A2K6Q6X9.1 #=GS A0A1W2F2Q7_KIBAR/95-197 AC A0A1W2F2Q7.1 #=GS A0A0Q2Y3A9_9RHOB/72-190 AC A0A0Q2Y3A9.1 #=GS A0A0V7ZVX5_9CYAN/85-291 AC A0A0V7ZVX5.1 #=GS B1WQ26_CROS5/318-528 AC B1WQ26.1 #=GS Q2HCM1_CHAGB/9-119 AC Q2HCM1.1 #=GS W2F0U3_9ACTN/182-324 AC W2F0U3.1 #=GS A0A429BUL6_9ACTN/186-369 AC A0A429BUL6.1 #=GS W5TNR1_9NOCA/190-331 AC W5TNR1.1 #=GS A0A068S096_9FUNG/2-367 AC A0A068S096.1 #=GS A0A1M7H967_9RHOB/101-176 AC A0A1M7H967.1 #=GS R7Z6F4_CONA1/25-384 AC R7Z6F4.1 #=GS A0A175WFR6_9PEZI/174-490 AC A0A175WFR6.1 #=GS A0A0G3AGJ5_9ACTN/212-402 AC A0A0G3AGJ5.1 #=GS A0A182EXB3_ONCOC/1-133 AC A0A182EXB3.1 #=GS A0A226P3Z0_COLVI/4-383 AC A0A226P3Z0.1 #=GS A0A365N4Q8_GIBIN/111-219 AC A0A365N4Q8.1 #=GS C4RQV2_MICS3/128-203 AC C4RQV2.1 #=GS A0A166A0X1_9AGAM/20-146 AC A0A166A0X1.1 #=GS A0A1Q5IZT1_9ACTN/42-195 AC A0A1Q5IZT1.1 #=GS A0A1B1BCW7_9ACTN/48-193 AC 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#=GS A0A150VED2_9PEZI/157-267 AC A0A150VED2.1 #=GS A0A066XQB2_COLSU/75-198 AC A0A066XQB2.1 #=GS A0A2K3UUQ9_9DEIO/127-206 AC A0A2K3UUQ9.1 #=GS A0A1E7N8U1_KITAU/41-198 AC A0A1E7N8U1.1 #=GS A0A2V1BUB2_9HELO/8-334 AC A0A2V1BUB2.1 #=GS A0A2H2ZPD4_9HYPO/144-552 AC A0A2H2ZPD4.1 #=GS A0A1V8TAK7_9PEZI/38-457 AC A0A1V8TAK7.1 #=GS I3MDP4_ICTTR/48-416 AC I3MDP4.1 #=GS A0A175VZ34_9PEZI/7-341 AC A0A175VZ34.1 #=GS N1RB12_FUSC4/16-159 AC N1RB12.1 #=GS A0A0F5VB51_9GAMM/30-211 AC A0A0F5VB51.1 #=GS A0A2M9JUD1_9ACTN/39-191 AC A0A2M9JUD1.1 #=GS A0A2U4BLN5_TURTR/233-391 AC A0A2U4BLN5.1 #=GS T0KTZ0_COLGC/101-499 AC T0KTZ0.1 #=GS A0A1L7WKT1_9HELO/192-308 AC A0A1L7WKT1.1 #=GS A0A0Q5DFM6_9RHIZ/101-176 AC A0A0Q5DFM6.1 #=GS A0A2A9NUB2_9AGAR/369-469 AC A0A2A9NUB2.1 #=GS G0RTH0_HYPJQ/277-512 AC G0RTH0.1 #=GS G0A9N2_COLFT/54-118 AC G0A9N2.1 #=GS A0A419MUW5_9SPHN/77-194 AC A0A419MUW5.1 #=GS A0A0H1AQT5_9GAMM/17-166 AC A0A0H1AQT5.1 #=GS A0A0A2L0A2_PENEN/177-358 AC A0A0A2L0A2.1 #=GS A0A2N1FBJ4_9FLAO/17-83 AC A0A2N1FBJ4.1 #=GS A0A2J6S154_9HELO/15-411 AC A0A2J6S154.1 #=GS A0A2K3QNE8_9HYPO/280-506 AC A0A2K3QNE8.1 #=GS A0A3N1JYD1_9BACT/100-233 AC A0A3N1JYD1.1 #=GS A0A318TLJ5_9BRAD/25-107 AC A0A318TLJ5.1 #=GS A0A238LFV5_9RHOB/89-185 AC A0A238LFV5.1 #=GS A0A0M7AL05_9RHOB/111-183 AC A0A0M7AL05.1 #=GS A0A179FID1_METCM/18-466 AC A0A179FID1.1 #=GS G0SG73_CHATD/7-331 AC G0SG73.1 #=GS A0A3N2NVT4_9ACTN/57-216 AC A0A3N2NVT4.1 #=GS H8MNF8_CORCM/26-170 AC H8MNF8.1 #=GS A0A2T4AD75_TRIHA/276-509 AC A0A2T4AD75.1 #=GS A0A443SLV9_9ACAR/200-420 AC A0A443SLV9.1 #=GS A0A2K3D2Z9_CHLRE/210-414 AC A0A2K3D2Z9.1 #=GS A1751_ARTBC/198-366 AC D4AZY1.1 #=GS A0A0V0VTI7_9BILA/1-367 AC A0A0V0VTI7.1 #=GS A0A316V1L0_9BASI/44-424 AC A0A316V1L0.1 #=GS Q7NDK5_GLOVI/48-133 AC Q7NDK5.1 #=GS A0A2L0WNI5_9RHIZ/17-116 AC A0A2L0WNI5.1 #=GS A0A0C1VBC2_9CYAN/231-323 AC A0A0C1VBC2.1 #=GS I0HAT5_ACTM4/77-384 AC I0HAT5.1 #=GS Q5RHM0_DANRE/45-431 AC Q5RHM0.1 #=GS A0A372GQ45_9ACTN/221-397 AC A0A372GQ45.1 #=GS A0A395GUA2_9EURO/186-328 AC 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#=GR A0A2K3D2Z9_CHLRE/210-414 pAS 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#=GR I0HAT5_ACTM4/77-384 pAS 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Q5RHM0_DANRE/45-431 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A0A1B1BCL7_9ACTN/197-321 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A0A3S9V5X5_9BACL/287-477 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S8BQE8_DACHA/229-627 ......................................................................................................kttasstsnpskpsttpassekckndlrridyvshpheis-----------.-.-----.-.-.......................................---.-..-....-....-................-...-......-................-...-.-.-..-.....-...-.....-----.............--.....-........-....-.....-..........-.....-...........-.....-.........-...-.....-...-......-......-.............-.....-........-........-...................-..........-..-..-...-...............-....-....-........-.........-....-......-......-........-........-.....-....................-.....-............-.....-........-........-.............-.......-...-..-...-...-..................-..........-...-.....-.................-................-..................-....-..................-..........-....-.....-....-..-.-.---.-...-....-......-.-...-.......--.....--..-.-..-..--.....-------.----..-.....-.....-......-.....-........-.....-..-.-......-......-...........-..................-...............-...............-......-....-...........-...............-...........-...........-.........-..................-..................-............-.........-............-........-..................-.........-.......-.........-.........-................-....-....-..........-...............-..................-...............-................-.........P.............S.........T.........A.........I.....I............R.....N.KQ.L..E..I.R......L...W.E......LG...C.L....F....A..F..A....T....R.L....N....EG..F......S....D....S..E.Idedfh........................ifplaV.-..-..-.-Kgdka...........skiaaL.N....M.....F..K.....D.......R.......L..E.M...S..Pg.......sVTWS.GHSFGG..A....TTVqfvkscwyspllngsedl......keplytpseallrhfhpsG.TI....G....R.D..................SK.A...P.....A.....T...V.L..L.....D...T.....W.....C..........L....P..........L..................L.............G.............E...........R...........Tra....lwrK...............P.........L.........P.........G...............P..............T.........L....G..I..L.......S.......W.....Q....F....yK.....W.....K....E........N........L......R........G.....F....RHvmsrkggifespwftdakddqtpvlmipdgseeadryeevtqrkklqrs....ssldvtpqlptgfrqgdeqklqdeqaveeeeeedvntlslkrtasrvsqrS..V....P...G......Q....P.....D......R......K.......L......Y....Y....A..A..G.........S...AH..MSQSD....F..G...I...L..F......P.......R......S......A.......K.......Y.......F.......T.....K.V.........-.....-....-...D...D.S.EGV.L.DLN.VR.A.V...VEFM....R..EQG..M..T.VA.D.F.KEGNK---------rdaeifge................................................................................................................................................................... #=GR S8BQE8_DACHA/229-627 pAS ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................*...........................................................................................................................*.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................