# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID PAF-AH_p_II #=GF AC PF03403.14 #=GF DE Platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform II #=GF AU Mifsud W;0000-0002-9805-6461 #=GF GA 19.8 19.8 #=GF NC 19.7 19.7 #=GF TC 19.8 19.8 #=GF SE Pfam-B_3469 (release 6.6) #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Domain #=GF RN [1] #=GF RM 9645224 #=GF RT The structure and function of platelet-activating factor #=GF RT acetylhydrolases. #=GF RA Derewenda ZS, Derewenda U; #=GF RL Cell Mol Life Sci 1998;54:446-455. #=GF RN [2] #=GF RM 9218411 #=GF RT Platelet-activating factor acetylhydrolases. #=GF RA Stafforini DM, McIntyre TM, Zimmerman GA, Prescott SM; #=GF RL J Biol Chem 1997;272:17895-17898. #=GF DR INTERPRO; IPR005065; #=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain; #=GF CC Platelet-activating factor acetylhydrolase (PAF-AH) is a #=GF CC subfamily of phospholipases A2, responsible for inactivation of #=GF CC platelet-activating factor through cleavage of an acetyl group. #=GF CC Three known PAF-AHs are the brain heterotrimeric PAF-AH Ib, #=GF CC whose catalytic beta and gamma subunits are aligned in #=GF CC Pfam:PF02266, the extracellular, plasma PAF-AH (pPAF-AH), and #=GF CC the intracellular PAF-AH isoform II (PAF-AH II). This family #=GF CC aligns pPAF-AH and PAF-AH II, whose similarity was previously #=GF CC noted. #=GF SQ 473 Q13093.1/49-416 -ASFGQTKIPR.G.NGPYS.V.G.......................................CTDLM...F....D.HT...N................KG.T.FLR...LYYPS-.........Q-..D........N....D.....R...L.....D...T..L....WI..P...N...K......E.............Y....F..W.....G.....L..........S..K..F...L...............G....T...H........W.........L...M......G..N......I........L....-.....R....L............LF.....G........S...M.T...TP..A.N....W......N...S.....P....L..............R..........PG.................E..K..Y.....P...LVVFSHG..LG......AFRTLYSAIGIDLASHGFIVAAVEH.....R......D.RS..ASATY......Y.......F...K...............DQ....S...........A..............A........E.I.......G..................-.......-......-.....-............-...-..................-...DK.........S......W................L..YL...R...T.....L........K......Q...E........E.........E....T......HI............RNEQVRQRA.K.ECS.QALSLI.LDID...HG..K....P..V.K..NA..................................L.D...L..K.FD..............MEQ....L.K.....D..S....ID.R..EK........IAVIGHSFGG.ATVI........................................QTL....SE.D.................QRF...R...C..GI.ALDA.W....M..........F.....P......L...........G........D......E...........V...........Y........S..........R.....I.......P...Q...............P.............L.....F.F..I.N....S..E.....Y.F.....Q..Y.P.A...N.I.I.....K...M.KK...................................................................................................CY...S...P.....D..K....E......R......K.......M.....I.T....I.R..G.........SVHQNFAD.F..T...FAT...G.......K..IIG....H..MLKL....KG..D...ID.S.NVA.IDLSNKASLAFLQ..KHL.GLHKD.F.DQWDCLIEGDDENL 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A0A3S4R178.1/215-438 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A0A3S4R178.1/468-864 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A0A1V9XFH2.1/148-323 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C7QEB2.1/241-341 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Q9F2X9.1/121-174 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R1ETV3.1/131-169 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Q9I2J7.1/104-240 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