# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID PAF-AH_p_II #=GF AC PF03403.14 #=GF DE Platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform II #=GF AU Mifsud W;0000-0002-9805-6461 #=GF GA 19.8 19.8 #=GF NC 19.7 19.7 #=GF TC 19.8 19.8 #=GF SE Pfam-B_3469 (release 6.6) #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Domain #=GF RN [1] #=GF RM 9645224 #=GF RT The structure and function of platelet-activating factor #=GF RT acetylhydrolases. #=GF RA Derewenda ZS, Derewenda U; #=GF RL Cell Mol Life Sci 1998;54:446-455. #=GF RN [2] #=GF RM 9218411 #=GF RT Platelet-activating factor acetylhydrolases. #=GF RA Stafforini DM, McIntyre TM, Zimmerman GA, Prescott SM; #=GF RL J Biol Chem 1997;272:17895-17898. #=GF DR INTERPRO; IPR005065; #=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain; #=GF CC Platelet-activating factor acetylhydrolase (PAF-AH) is a #=GF CC subfamily of phospholipases A2, responsible for inactivation of #=GF CC platelet-activating factor through cleavage of an acetyl group. #=GF CC Three known PAF-AHs are the brain heterotrimeric PAF-AH Ib, #=GF CC whose catalytic beta and gamma subunits are aligned in #=GF CC Pfam:PF02266, the extracellular, plasma PAF-AH (pPAF-AH), and #=GF CC the intracellular PAF-AH isoform II (PAF-AH II). This family #=GF CC aligns pPAF-AH and PAF-AH II, whose similarity was previously #=GF CC noted. #=GF SQ 1778 Q13093.1/49-416 -ASFGQTKIPR.G.NGPYS.V.G.......................................CTD.L..M...F....D.H..T......N................K...G.T.F..L.R...LYYPS-.............Q-.....D........N....D.....R...L.....D.....T.....L......W...I.....P...N.....K......E.............Y.....F........W........G.....L..........S..K..F...L...............G....T...H........W.........L...M......G......N........I........L.....-.....R.....L............L...F........G........S...M.......T...T.P..A...N.........W..........N...S.....P.................L.................R...............P....G.................E.........K....Y.....P....LV.VFSHG..L.G......AF..R.......TL.YS..A.I..GID..LASHGFIVAAVEH.....R......D.....R........S...A.......SA......T.Y......Y..................F.....K...............D.Q....S...........A..............A.........E.I.......G..................-............-........-........-......................-...-....................-.......D.......K.........S........W................L.....Y..L.......R....T.....L...............K................Q........E........E.........E....T.........H..I............R...NEQ......VRQRA.K.ECS...Q...A....L.S..L..I....L....D.ID....HG..K......P....V....K..N.A..................................L.D...L..K.FD...............ME....Q.....L..K.....D.......S.......I..D.R..EK.........IAVIGHSFGG.ATVI..........................................Q.TL....SE.D.................QR.F...R.....C...G...I.A.L.....DA.......W.....M..........F.....P..........L..................G.............D.............E...........V...........Y........S...............R......I.........P........Q...............P.............L.....F.F..I..N.......S.......E.....Y..F.....Q.....Y....P....A........N........I...I........K.....M....KK...................................................................................................C...Y...S...P.....D...K.....E......R......K.......M......I...T....I..R..G.........SVHQ...NFAD.F..T...FAT.....G.......K...I...I.......G.......H.......M.......L.....K.L.........KG....D...I...D.S.NVA.IDLSNK.A.S...LAFLQ..KHL..G..L.HKD.F.DQWDCLIEGDDENL Q90678.1/32-410 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A0A3S4R178.1/215-438 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A0A3S4R178.1/468-864 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H3BAS5.1/4-378 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Q22943.2/5-363 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K1PWP2.1/43-427 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B3S293.1/11-371 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A0A137P3W5.1/5-377 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A0A074XXK9.1/194-497 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