# STOCKHOLM 1.0
#=GF ID PAF-AH_p_II
#=GF AC PF03403.14
#=GF DE Platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform II
#=GF AU Mifsud W;0000-0002-9805-6461
#=GF GA 19.8 19.8
#=GF NC 19.7 19.7
#=GF TC 19.8 19.8
#=GF SE Pfam-B_3469 (release 6.6)
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP Domain
#=GF RN [1]
#=GF RM 9645224
#=GF RT The structure and function of platelet-activating factor
#=GF RT acetylhydrolases. 
#=GF RA Derewenda ZS, Derewenda U; 
#=GF RL Cell Mol Life Sci 1998;54:446-455.
#=GF RN [2]
#=GF RM 9218411
#=GF RT Platelet-activating factor acetylhydrolases. 
#=GF RA Stafforini DM, McIntyre TM, Zimmerman GA, Prescott SM; 
#=GF RL J Biol Chem 1997;272:17895-17898.
#=GF DR INTERPRO; IPR005065;
#=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC Platelet-activating factor acetylhydrolase (PAF-AH) is a
#=GF CC subfamily of phospholipases A2, responsible for inactivation of
#=GF CC platelet-activating factor through cleavage of an acetyl group.
#=GF CC Three known PAF-AHs are the brain heterotrimeric PAF-AH Ib,
#=GF CC whose catalytic beta and gamma subunits are aligned in
#=GF CC Pfam:PF02266, the extracellular, plasma PAF-AH (pPAF-AH), and
#=GF CC the intracellular PAF-AH isoform II (PAF-AH II). This family
#=GF CC aligns pPAF-AH and PAF-AH II, whose similarity was previously
#=GF CC noted.
#=GF SQ 5882
Q13093.1/49-416        -ASFGQTKIPR.G.NGPYS.V.G.......................................CTD.L..M....F.....D................H...T......N................K...G.T.F..L.....R...L.....Y..YPS-.............Q-.....D........N....D.....R..........L.....D...........T.....L.........W...I......P...N........K......E.............Y.....F........W........G...................L..........S..K..F...L...............G....T....H........W.........L....M......G......N........I........L.....-.....R.....L............L....F........G........S.............M.......T...T..P.....A...N..................W..........N...S.....P.................L.................R..................P....G..................E..........K....Y.....P....LV.VFSHG..L.G......AF...R.......T....L.YS..A.I..GID..LASHGFI.VAAV...E...H.....R......D.....R........S.....A.......S..........A......T......Y...........Y..................F...............K...............D......Q.....S...........A...............A...........E...........I.........G..................-..................-............-.........-......................-........-....................-.........D.......K.........S.........W................L.....Y....L..........R...............T..................L...............K................Q..........E.............E.........E.........T.........H..I............R.....N..EQ......V..R..Q...R......A...K........E......C..S...Q...A....L....S..L..I....L....D.I......D....HG..K......P....V....K..N.A..................................L.D...L..K.F.D....................M.E....Q.....L..K.....D.......S.......I..D.R...E..K.........IAVI.GHSFGG..A....TVI...........................................Q.TL....S....E.D..................QR.F...R.....C......G...I..A..L.....D...A.......W.....M..........F......P..........L..................G.............D.............E...........V...........Y........S...............R.........I.........P........Q...............P..............L.........F....F..I..N.......S.......E.....Y....F.....Q.....Y....P....A........N........I........I........K.....M.....K.K.......................................................................................................C...Y....S...P......D....K.....E......R......K.......M......I....T.......I..R.....G.........SVHQ...NF.AD.F..T...FA..T......G.......K......I.......I.......G.......H.......M.......L.....K.L.........K.....G....D...I...D.S.NVA.I.DLS.NK.A.S...LAFL....Q..KHL..G..L.HK.D.F.DQWDCLIEGDDENL
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Q90678.1/32-410        -GAEKGYRIPA.G.KGPHA.V.G.......................................CTD.L..M....T.....G................D...A......A................E...G.S.F..L.....R...L.....Y..YLSC.............D-.....D........T....D.....T..........E.....E...........T.....P.........W...I......P...D........K......E.............Y.....Y........Q........G...................L..........S..D..F...L...............N....V....Y........R.........A....L......G......E........R........L.....F.....Q.....Y............Y....V........G........S.............V.......T...C..P.....A...K..................S..........N...A.....A.................F.................K..................P....G..................E..........K....Y.....P....LL.VFSHG..L.G......AF...R.......T....I.YS..A.I..CIE..MASQGFL.VAAV...E...H.....R......D.....E........S.....A.......S..........A......T......Y...........F..................C...............K...............K......K.....A...........D...............S...........E...........P.........E..................E..................D............Q.........T......................S........G....................V.........E.......K.........E.........W................I.....Y....Y..........R...............K..................L...............R................A.........gE.............E.........E.........R.........C..L............R.....H..KQ......V..Q..Q...R......A...Q........E......C..I...K...A....L....N..L..I....L....K.I......S....SG..E......E....V....M..N.V..................................L.N...S..D.F.D....................W.N....H.....L..K.....D.......S.......V..D.T...S..R.........IAVM.GHSFGG..A....TVI...........................................E.SL....S....K.E..................IR.F...R.....C......G...I..A..L.....D...A.......W.....M..........L......P..........V..................G.............D.............D...........T...........Y.......qS...............S.........V.........Q........Q...............P..............L.........L....F..I..N.......S.......E.....K....F.....Q.....W....A....A........N........I........L........K.....M.....K.K.......................................................................................................L...S....S...N......D....T.....N......K......K.......M......I....T.......I..K.....G.........SVHQ...SF.PD.F..T...FV..S......G.......E......I.......I.......G.......K.......F.......F.....K.L.........K.....G....E...I...D.P.NEA.I.DIC.NH.A.S...LAFL....Q..KHL..S..L.KR.D.F.DKWDSLVDGIGPNV
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