# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID GcpE #=GF AC PF04551.15 #=GF DE GcpE protein #=GF AU Bateman A;0000-0002-6982-4660 #=GF GA 32.0 32.0 #=GF NC 31.6 31.4 #=GF TC 32.6 32.6 #=GF SE Pfam-B_1482 (release 7.5) #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Family #=GF RN [1] #=GF RM 1521767 #=GF RT Sequence and characterization of the gcpE gene of Escherichia #=GF RT coli. #=GF RA Baker J, Franklin DB, Parker J; #=GF RL FEMS Microbiol Lett 1992;73:175-180. #=GF RN [2] #=GF RM 11274098 #=GF RT GcpE is involved in the 2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate #=GF RT pathway of isoprenoid biosynthesis in Escherichia coli. #=GF RA Altincicek B, Kollas AK, Sanderbrand S, Wiesner J, Hintz M, Beck #=GF RA E, Jomaa H; #=GF RL J Bacteriol 2001;183:2411-2416. #=GF DR INTERPRO; IPR004588; #=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region; #=GF CC In a variety of organisms, including plants and several #=GF CC eubacteria, isoprenoids are synthesised by the #=GF CC mevalonate-independent 2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate (MEP) #=GF CC pathway. Although different enzymes of this pathway have been #=GF CC described, the terminal biosynthetic steps of the MEP pathway #=GF CC have not been fully elucidated. GcpE gene of Escherichia coli is #=GF CC involved in this pathway [2]. #=GF SQ 11328 W4LW52.1/19-300 TREVKVG....D....VGIGG......D......N...PIRIQSMT...I.......S....DT..MD...........TAATV....AE..TI......ELV......EAGCEIVRITAPSLNEAENL.R.HIKAELK.RQ....GV.N.V.P.I.IADIHFTP..N...A...AL....L....A...A.EY.......-VEKVR.INPGNYAD..KKKfaereytds................................eyeaeleriEARFKPLVLKVKQCGVAMRIGTNHGSL.......S..D.RIMNR..F..........GD...-T.....P............................QGMVESALE.......FLR.ICR.RYDYH..D..IILS.M..KA..SN.P...L..VMIQ..AY....R....L..L....A.T.R.M.Dde.................................gmdYP..F....HL.....G.V......T.....E..A..G...D..G....E......E.G.......R..I.K..SAVGIGSLLE..........DGIGD.........TI.....R......V.....S...L...T...E..D.A...........V.H.E.....I.......P.....A....A..Q.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TIA..........SPYN.....T...R.L......A........A...---..-.-.-..----...---.-..-.-.--.---------...---...-..................------------........--------------....---...---.....-------.......--.----..----...---------- 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M3IJL0.1/17-297 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M3IJL0.1/465-652 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