# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID AAA_5 #=GF AC PF07728.15 #=GF DE AAA domain (dynein-related subfamily) #=GF AU Studholme DJ;0000-0002-3010-6637 #=GF GA 21.3 21.3 #=GF NC 21.2 21.2 #=GF TC 21.3 21.3 #=GF SE PfamB-136 (Release 14.0) #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Domain #=GF WK AAA_proteins #=GF RN [1] #=GF RM 7646486 #=GF RT A 200-amino acid ATPase module in search of a basic function. #=GF RA Confalonieri F, Duguet M; #=GF RL Bioessays 1995;17:639-650. #=GF RC A large extension of the family #=GF RN [2] #=GF RM 9927482 #=GF RT AAA+: A class of chaperone-like ATPases associated with the #=GF RT assembly, operation, and disassembly of protein complexes. #=GF RA Neuwald AF, Aravind L, Spouge JL, Koonin EV; #=GF RL Genome Res 1999;9:27-43. #=GF DR INTERPRO; IPR011704; #=GF DR PROSITE; PDOC00572; #=GF DR SCOP; 1nsf; fa; #=GF DR HOMSTRAD; AAA; #=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain; #=GF CC This Pfam entry includes some of the AAA proteins not detected #=GF CC by the Pfam:PF00004 model. #=GF SQ 20659 F7XNB1.1/316-449 NVLLIG.D..A.GT.G.K..D...W..L.A....M.M..Y..G.R.IM.............................GED..P.......I.V...V.......S......L....S.......E...D...M......E....G......Q......E.....L.........I.A...S...R.G.LE...............................AGL...T..V....W...E....Y.....S....Q.....I...V..N..AYV...........................................................................NG.R.I...I....I.LD......E..VNKT........R...P........G....V.C.......A.....I....L....N.E....I....M......E....A......P......E......L.....E.....M....P.....D......G....S...W..V..S..R..C.E..G.--...----.................................................................FQ.II.A.TMNEAGe........eYGGY.DI..DPDFRDRF F7XNB1.1/733-878 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