# STOCKHOLM 1.0 #=GF ID DnaA_N #=GF AC PF11638.9 #=GF DE DnaA N-terminal domain #=GF AU Pollington J;0000-0002-8158-8998 #=GF AU Bateman A;0000-0002-6982-4660 #=GF SE pdb_2jmp & Jackhmmer:B3CS04 #=GF GA 24.60 24.60; #=GF TC 24.60 24.60; #=GF NC 24.50 24.50; #=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann #=GF SM hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq #=GF TP Domain #=GF RN [1] #=GF RM 17680349 #=GF RT NMR structure of the N-terminal domain of the replication #=GF RT initiator protein DnaA. #=GF RA Lowery TJ, Pelton JG, Chandonia JM, Kim R, Yokota H, Wemmer DE; #=GF RL J Struct Funct Genomics. 2007;8:11-17. #=GF DR INTERPRO; IPR024633; #=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain; #=GF CC This family of proteins represents the N-terminal domain of #=GF CC DnaA, a protein involved in the initiation of bacterial #=GF CC chromosomal replication. The structure of this domain is known #=GF CC [1]. It is also found in three copies in some proteins such as #=GF CC Swiss:B5V0X4. The exact function of this domain is uncertain but #=GF CC it has been suggested to play a role in oligomerisation. #=GF SQ 26046 A0A1T2PP84.1/5-58 ---WT.E.VK..E..K..I..R..P..Q..I..S..KPS...........YE.TWF.....T.....N...T...T.V......-..Y.......L...-...EDD...........iLTI.Y.C...P....N..E...F.A..R..D.WLESH..................YKELV------ A0A1T2PP84.1/94-153 --SWD.E.VK..K..A..L..R..P..K..I..A..EKT...........FM.TWI.....R.....N...T...N.A......-..T.......I...K...DNK............VTI.F.C...E....D..A...F.H..R..D.LLEGE..................YKNIISSTVQ- A0A1T2PP84.1/195-253 ---WE.E.IK..E..K..I..K..S..K..I..S..RPS...........YE.TWV.....K.....E...T...T.A......-..S.......I...N...ENS............LTI.Y.F...E....N..E...F.Q..Q..E.WVKKS..................YKDLISQIAK- A0A2C2C044.1/5-58 ---WT.E.VK..E..K..I..R..P..Q..I..S..KPS...........YE.TWF.....T.....N...T...S.V......-..Y.......L...-...EDD...........iLTI.Y.C...P....N..E...F.A..R..D.WLESH..................YKELV------ A0A2C2C044.1/94-154 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